對于水樣保存的方法，主要有冷藏和加入保存劑兩種：

冷藏：原則上講，從采樣到分析的時間間隔應越短越好。水樣若不能及時進行分析，一般應保存在4℃的低溫暗室內。這樣可使生物活性受到抑制，生物化學作用顯著降低，以最大限度保持水質的原始狀態。

加入保存劑：保存劑可以在采樣后立即往水樣中投加，也可以事先將保存劑加到采樣容器中。對保存藥劑的一般要求是：保存劑不能干擾待測物的測定，不能影響待測物的濃度。

由于水樣的組分、濃度和性質不同，同樣的保存條件下不能保證適用于所有類型的樣品，在采樣前應根據樣品的性質、組成和環境條件來選擇適宜的保存方法和保存劑。

國標GB/T5750.2-2006提供了常用的保存方法，具體如下：

水樣中一些常規項目對水樣的存放容器和保存方法具體要求如下：

1.氟化物與玻璃能反應，測氟化物的水樣應使用聚乙烯塑料瓶保存，可保存14天。

2.測六價鉻的水樣要求采樣容器內壁應光滑、無損。

3.測亞硝酸鹽氮和苯并(a)芘的水樣應避光冷藏，盡快測定。

4.測鹵代烴類的水樣應現場處理后避光保存，在4小時內測定。

5.測色度、濁度、電導率的水樣應冷藏保存。

6.測揮發性有機物的水樣用HCl(1:10)調制 pH≤2，加入抗壞血酸0.01~0.02g除去殘留的余氯，在12小時內測定。

7.測氰化物、揮發酚類的水樣要在玻璃瓶內加NaOH至pH≥12，冷餐避光保存，24小時內測定，如有游離余氯，加亞砷酸鈉除去。

8.測氨氮、硝酸鹽氮、耗氧量的水樣應每升水樣加入0.8ml濃硫酸，0~4℃避光保存。

9.測農藥類、除草劑類、鄰苯二甲酸酯類的水樣，要加入抗壞血酸0.01~0.02g除去殘留余氯保存于玻璃瓶內，24小時內測定。

10.測砷的水樣，加硫酸至pH≤2，保存期限為7天。

11.測一般金屬的水樣，加硝酸至pH≤2，保存期限為14天。

征求意見稿GB/T5750.2-20XX修改了常用的保存方法，具體如下：