通常選用共振吸收線為分析線，測定高含量元素時，可以選用靈敏度較低的非共振吸收線為分析線。As、Se等共振吸收線位于200nm以下的遠紫外區，火焰組分對其有明顯吸收，故用火焰原子吸收法測定這些元素時，不宜選用共振吸收線為分析線。

2.狹縫寬度選擇

狹縫寬度影響光譜通帶寬度與檢測器接受的能量。原子吸收光譜分析中，光譜重疊干擾的幾率小，可以允許使用較寬的狹縫。調節不同的狹縫寬度，測定吸光度隨狹縫寬度而變化，當有其它的譜線或非吸收光進入光譜通帶內，吸光度將立即減小。不引起吸光度減小的最大狹縫寬度，即為應選取的合適的狹縫寬度。

3.空心陰極燈的工作電流選擇

空心陰極燈一般需要預熱10-30min才能達到穩定輸出。燈電流過小，放電不穩定,故光譜輸出不穩定，且光譜輸出強度小；燈電流過大，發射譜線變寬，導致靈敏度下降，校正曲線彎曲，燈壽命縮短。選用燈電流的一般原則是，在保證有足夠強且穩定的光強輸出條件下，盡量使用較低的工作電流。通常以空心陰極燈上標明的最大電流的一半至三分之二作為工作電流。在具體的分析場合，最適宜的工作電流由實驗確定。

4.原子化條件的選擇

①火焰類型和特性：在火焰原子化法中，火焰類型和特性是影響原子化效率的主要因素。對低、中溫元素，使用空氣-乙炔火焰；對高溫元素，宜采用氧化亞氮-乙炔高溫火焰；對分析線位于短波區（200nm以下）的元素，使用空氣-氫火焰是合適的。對于確定類型的火焰，稍富燃的火焰(燃氣量大于化學計量)是有利的。對氧化物不十分穩定的元素如Cu、Mg、Fe、Co、Ni等，用化學計量火焰（燃氣與助燃氣的比例與它們之間化學反應計量量相近）或貧燃火焰（燃氣量小于化學計量）也是可以的。為了獲得所需特性的火焰，需要調節燃氣與助燃氣的比例。

②燃燒器的高度選擇：在火焰區內，自由原子的空間分布是不均勻，且隨火焰條件而改變，因此，應調節燃燒器的高度，以使來自空心陰極燈的光束從自由原子濃度最大的火焰區域通過，以期獲得高的靈敏度。

③程序升溫的條件選擇：在石墨爐原子化法中，合理選擇干燥、灰化、原子化及除殘溫度與時間是十分重要的。干燥應在稍低于溶劑沸點的溫度下進行，以防止試液飛濺。灰化的目的是除去基體和局外組分，在保證被測元素沒有損失的前提下應盡可能使用較高的灰化溫度。原子化溫度的選擇原則是，選用達到最大吸收信號的最低溫度作為原子化溫度。原子化時間的選擇，應以保證完全原子化為準。原子化階段停止通保護氣，以延長自由原子在石墨爐內的平均停留時間。除殘的目的是為了消除殘留物產生的記憶效應，除殘溫度應高于原子化溫度。

5.進樣量選擇

進樣量過小，吸收信號弱，不便于測量；進樣量過大，在火焰原子化法中，對火焰產生冷卻效應，在石墨爐原子化法中，會增加除殘的困難。在實際工作中，應測定吸光度隨進樣量的變化，達到最滿意的吸光度的進樣量，即為應選擇的進樣量。