大棚內的土壤和環境條件與露地不同，因而在施肥方法上也有很大差異。下面對茄子整個生育期的施肥方法作詳細介紹。
    一、種子。要想獲得較高產量，必需從“小”抓起，對種子進行施肥也是比較重要的。種子的施肥主要是指用微生物菌肥拌種，菌肥拌種不但可以保證種子發芽所需的養分，還可以為種子的發芽提供良好的土壤環境，有利于提高出苗率和培育壯苗。用菌肥拌種應注意兩個問題：1、選用質量合格的菌肥。劣質菌肥對種子有害而無益，千萬別施用。應選擇有可靠技術背景和技術來源、質量性能穩定的菌肥，如金寶貝菌肥。2、盡量減少微生物的死亡。菌肥要避免陽光直射，拌種時應在陰涼處操作，拌種后要及時播種，并立即覆土。菌肥不可與有害農藥、化肥混合施用。
    二、苗期。苗期的生長狀況可以影響到茄子的整個生育期，特別是對花芽分化極為重要。所以，培育壯苗是獲得高產的關鍵，不可忽視。在苗期多施磷肥（菌根菌劑可以大大提高磷肥利用率），可以提早結果。9平方米苗床可施入過篩腐熟有機肥200千克（最好用發酵助劑發酵好的有機肥）、過磷酸鈣與硫酸鉀各0.5千克；當茄苗長到4～5片真葉時，如果下部葉片顏色較淡，可葉面噴施0.1%～0.2%的磷酸二氫鉀或尿素，這樣可以保證培育出壯苗。
    三、基肥。茄子生長結果時間長，根深葉茂，是需肥多而又耐肥的蔬菜作物，施足底肥是獲得高產的基礎。如果大棚采用地膜覆蓋栽培，因后期追肥不便，應該把大部分肥料作基肥施入。老棚與新棚的施肥量有所不同。因為老棚比新棚土壤里殘留的肥分多，新棚要比老棚多施肥。大多數老棚土壤中氮素過剩，磷肥富集，鉀肥不足。每667平方米施用有機肥6000千克，如果是老棚可以減少施用量，加施20～30千克硫酸鉀。有機肥和鉀肥要全面撒施，隨后翻入土中。需要特別注意的是，有機肥一定要充分腐熟，最好用專業的發酵劑進行處理。不但可以減少養分流失，還可以徹底清除有機肥中的病菌、蟲卵等外源有害物。如能配合施用微生物菌肥，則更好。
    四、追肥。茄子的追肥應以速效氮肥為主，配施磷、鉀肥，并適量加入生物菌肥。按茄子生長期，可分為催果肥、盛果肥和滿天星肥。
    1、催果肥：當“門茄”達到“瞪眼期”，果實開始迅速生長，整個植株進入果實生長為主的時期。莖葉也開始旺盛生長，需肥量增加。此時進行第一次追肥，稱為催果肥，這是關鍵施肥時期。催果肥用量，每667平方米施硫酸銨30-40千克，或尿素15-20千克，穴施或溝施，施后蓋土、澆水。
    2、盛果肥：當“對茄”果實膨大，“四門斗”開始發育時，是茄子需肥的高峰期，這時再進行第二次追肥，即盛果肥。以速效氮肥為主，配施磷、鉀肥，還要注意葉面追施鈣、硼、鋅等中量及微量元素肥料。結合澆水，每667平方米追施腐熟的稀糞尿1000千克或磷酸二銨20-30千克。
    3、滿天星肥：第二次追肥后到最后1次采收前10天，每一層果實開始膨大時，約每隔10天左右追1次，共追5-6次肥。化肥和稀糞尿交替使用最佳。
    4、根外追肥：從成果期開始，可根據長勢噴施0.2%-0.3%的尿素、0.2%-0.3%磷酸二氫鉀、0.1%-0.2%硫酸鎂等肥料。一般7-10天一次，連噴2-3次。
    5、微生物菌肥：合格的生物菌肥不僅含有大量固氮、解磷、解鉀活性菌，還含有有機質、腐殖酸和微量元素等。與其它肥料配施，不但可以節約肥料使用量，而且可以解決土壤板結、增加土壤微生物含量等問題。
    通過以上方法進行施肥，相信廣大種植戶可以獲得較為理想的產量，從而達到增產、改善品質和增收的目的。