芥末，辛熱無毒，具有溫中散寒，通利五臟、利膈開胃的作用，能利九竅、健胃消食等。芥末香辣味可刺激唾液和胃液的分泌，有開胃之功，能增強人的食欲。它還具有解毒功能，能解魚蟹之毒，故生食三文魚等生鮮食品經常會配上芥末。芥末嗆鼻的主要成分是異硫氰酸鹽。這種成分不但可預防蛀牙，而且對預防癌癥、防止血管內凝塊、輔助治療哮喘等也有一定的效果。芥末還有預防高血脂、高血壓、心臟病，減少血液黏稠度等功效。
在芥末中酌量添加些糖或食醋，能緩沖辣味，并使其風味更佳。

芥末具有強烈的刺激性，有胃炎或消化道潰瘍的人忌食。芥末能“催人淚下”，眼睛有炎癥的人不宜食用。一次不要食用太多，以免傷胃。