蜜橘風味獨特，汁多味甜，多數品種售價比其他柑橘高，不過由于其皮薄易損傷等原因，儲藏有其獨特之處，果農應當留心。 

    一、紅橘地溝儲藏：選一未耕種過、地勢平坦、排水好、屬沖積或紫色土的地方挖個露天土溝，要求斷面呈倒梯形，上寬90-100厘米、底寬30-40厘米，待溝內三面土自然風干呈白色時，用800毫克/公斤的多菌靈和1000毫克/公斤的托布津溶液噴灑地溝消毒，然后在溝內鋪墊一層經福爾馬林密閉熏蒸消毒的稻草。地溝儲藏的紅橘宜在八成熟時采收，采后當天用200毫克/公斤的2，4-D加500-800毫克/公斤的多菌靈浸泡30秒，取出自然晾至果失重3%時入溝散堆儲藏。果在溝內中部堆高35-45厘米，溝四周堆高30厘米，最后在堆上面再蓋一層10-15厘米厚的已消毒的稻草。此法可儲藏60-70天，腐爛率5%以下。 

    二、紅橘松針儲藏：選一通風、干燥、涼爽房屋的一角，打掃干凈后墻壁及地面撒上石灰粉消毒。果實采后當天用200毫克/公斤的2，4-D加500毫克/公斤的多菌靈溶液浸洗果30秒后，取出放陰涼通風處晾3-4天并使果失重2-3%，接著先在地面鋪一層6-7厘米厚的鮮松針，然后在松針上放一層果，果面再鋪一層厚3-4厘米的松針，如此堆放4-5層。此法中松針的用量為果實的7-10倍，要求每層不露果實。本法可儲果90-100天，好果率85-95%。 

    三、南豐蜜橘中草藥防腐保鮮儲藏：先用高粱姜、艾葉、野菊花按1:1:15熬煮，然后將原液稀釋15倍浸洗當天采收的果實，取出晾3-4天后放低溫庫儲藏。此法儲藏果實80-90天，腐果率僅9%。 

    四、蜜橘塑膜袋單果包裝儲藏：此法適用于紅橘等果型較大的品種。采果當天用多菌靈250-500毫克/公斤或抑霉唑500毫克/公斤，或托布津500-800毫克/公斤加2，4-D100-200毫克/公斤的溶液浸洗果20-30秒，然后將果裝入竹筐等容器內放陰涼通風處發汗3-5天，使果實失重3-4%，再用厚0.01毫米厚聚乙烯薄膜保鮮袋進行單果包裝。如是南豐蜜橘等小果品種，則應將發汗后的果裝入內墊大保鮮薄膜袋的塑料或竹箱內。果實單果包裝并裝箱后，可儲藏于打掃干凈并消毒的普通房內。儲藏期間要盡量將溫度控制在4-20℃、相對空氣濕度80-85%。此法可儲藏果實3-4個月。
 
    五、蜜橘塑膜大帳儲藏：將當天采的果用橘腐凈100倍液浸洗果1分鐘，取出后放陰涼通風處發汗3-5天，再將果實裝入已消毒的塑料或內墊消毒紙屑的竹筐等容器中。裝果箱要碼在打掃干凈并消毒的房內；果箱一般擺放4-5層，最上層果箱的表面要墊上消毒的草紙，接著在其上套蓋厚0.06毫米的聚乙烯薄膜大帳。儲藏期間每隔6-7天揭開大帳換氣1次。此法可儲藏蜜橘至春節。