1、精細采收。馬水桔采收過早或過遲都會影響它的損耗、腐爛、發病及貯藏壽命，要求在果實充分生長、累積了足夠的糖分并且含糖量不再大幅度增加、皮色一般在轉黃時采收。采收時應選擇晴朗露水已干的午前進行。陰雨天、霧天及露水未干時、中午以后，不宜采收。采收時，不要拉斷果柄，必須用果剪剪平果蒂。

    采剪的方法是：第一剪剪至離果蒂1厘米處，第二剪剪齊萼片，整齊剪去果柄，避免果柄過長過短，因過長則傷及其他果實，過短又造成果實傷口。樹上分級、樹下包裝，部分人員先采摘一級果，隨后用大部分人員采收二級果，其他果另行處理，避免采果、分級、包裝時造成機械傷。

    2、藥劑防腐。采前、采后進行藥劑處理是保證果實貯藏質量，減少腐爛的重要措施之一。采收前一周，用50--100ppm的2，4--D噴灑果蒂；也可用1000倍的多菌靈或托布津與50--100ppm的2，4--D混合液全樹噴灑，有消滅初期附在果實上的病菌作用，對果實起到防腐的效果。藥劑噴射時要仔細，果實部位必須全部噴到。采收后，用200ppm2，4--D和1000倍的托布津或多菌靈混合液浸果，能起到防腐的作用。為了減少病菌的感染，凡裝過桔子的箱子都要用0.1%的多菌靈或0.2%托布津噴灑消毒。特別是去年用過的箱子，要清洗干凈、曬干，再用托布津或多菌靈噴灑消毒。

    3、倉庫貯藏。馬水桔的常溫貯藏庫，不需要特殊的設備，一般的民房、普通倉庫都可使用，庫房宜通風良好，不漏雨，果堆不會受到陽光的照射，并能防止鼠害。庫房在果品庫前兩周，要用硫磺粉(100克/平方米)密封熏蒸24小時，或用4%的漂白粉噴灑，然后通風換氣，準備貯藏。初入庫時要打開所有的門窗，有利于通風換氣和馬水桔果實的發汗、散熱。