菠蘿采收后仍然進行著新陳代謝過程，其中以呼吸作用較旺盛，菠蘿果實淀粉和含糖量都逐漸下降，果肉組織逐步變軟，果實品質達最佳水準后即逐漸下降，以致過熟、衰敗腐爛。由于菠蘿主要在高溫季節成熟，給貯藏保鮮帶來很大困難。目前應用的貯藏保鮮主要有低溫同藏法，氣調貯藏法和藥劑保鮮法。

　　(一)低溫貯藏法　主要是通過降低溫度來抑制呼吸作用，達到貯藏保鮮的目的。菠蘿果實對貯藏溫度的反應與菠蘿果實的成熟度有關，若將采收時沒有一點黃色的全綠果實貯藏于10℃溫度下，則極易產生冷害。據美國夏威夷試驗結果，在7℃時最大貯藏壽命四個星期，印度推薦的貯運適溫是8℃，南非則推薦8.5℃。

　　(二)氣調貯藏法　主要是通過減少貯藏庫中的含氧量和適當的低溫來抑制呼吸作用達到保鮮的目的。據美國夏威夷大學研究由2%氧氣和98%氮氣組成的氣調大氣，在7.2℃溫度下，可以延長菠蘿的保鮮期。

　　(三)藥物保鮮法　據報道，把一半成熟的菠蘿在100ppm2，4，5－T液中浸泡后，在常溫下可保鮮6～14天。另據報道，將25%小果變黃的菠蘿用100ppm萘乙酸鈉鹽溶液浸濕后，在室溫下貯藏9天，這些果只有50%小果變黃，能保持菠蘿特有的風味和果肉組織的正常結構。用300ppm度的苯萊特浸果柄新鮮切口，可有效地防止從切口入侵的各類病菌。