柚貯藏病害分真菌性病害和生理性病害兩大類。
  1．真菌性病害
  (1)青霉病和綠霉病 青霉病菌(penicillium italicum wehmer．)和綠霉病菌(penicilliumdigitatum sate．)使果實發病過程和癥狀很相似，初期出現水漬狀淡褐色圓形病斑，病部果皮變軟腐爛，后擴展迅速，用手按壓病部果皮易破裂，病部先長出白色菌絲，很快就轉變為青色或綠色霉層。兩病癥狀區分。  青、綠霉病菌均可以在各種有機物質上營腐生生活，并產生大量的分生孢子擴散在空氣中，通過氣流傳播，萌發后的孢子必須通過果皮的傷口才能侵入危害，引起果實腐爛。以后在病部又能產生大量的分生孢子進行重復侵染。在貯藏庫中，青霉病菌侵入果皮后，能分泌一種揮發性物質，將接觸到的健康果果皮損傷，引起接觸傳播，而綠霉菌則不能。
  (2)黑腐病(alternariacirri pierce) 此病在果實上有兩種癥狀類型。一種是果皮先發病，外表的癥狀明顯，病菌由果皮侵入果肉，引起果肉腐爛。另一種是果實外表不表現癥狀，而果心和果肉已發生腐爛。前者是由于果皮受傷后，病菌從損傷處侵入而引起發病，初期在果皮上出現水漬狀淡褐色病斑，擴大后病部果皮稍下陷，長出灰白色菌絲，很快轉變成墨綠色的霉層，病部果皮腐爛，果肉變質味苦，不能食用。后者是由于病菌在幼果期侵入，潛伏在果心，以后病菌在果實內部擴展并引起果心和果肉腐爛，而外表無明顯的癥狀。
  (3)蒂腐病[phomopsiscitri(fawc．)wolf)]又名褐色蒂腐病，癥狀主要特征為環繞蒂部出現水漬狀，淡褐色病斑，逐漸變成深褐色，病部漸向臍部擴展，邊緣呈波紋狀，最后可使全果腐爛。患病果皮較堅韌，手指按壓有革質柔韌感。由于病果內部腐爛較果皮腐爛快，因此，當外果皮變色擴大至果面1／3～2／3時，果心已全部腐爛，故有“穿心爛”之稱。
  (4)焦腐病(diplodianatalensis pole-evans) 又名黑色蒂腐病，果實發病多自蒂部或近蒂部傷口開始。病部呈黑色病斑，后蔓延全果并進入果心。腐爛果實常溢出棕褐色粘液，剖開病果可看到腐爛后的果心和果肉變為黑色。
  (5)疫菌褐腐病[phytophthora citrothora(smith et smith)leonian] 果實感染后，表皮發生污褐色至褐灰色的圓形斑，很快蔓延至全果。病果有強烈的皂臭味，在干燥條件下病果皮質地堅韌，在高濕條件下病果長出白色絨毛菌絲。此病在貯藏期傳染甚速，在窖內可以使全窖腐爛，在木箱內全箱腐爛。
  (6)酸腐病[oospora citri—aurantii(ferr)sacc] 病菌從傷口或果蒂部入侵，病部首先發軟，變色為水漬狀，極柔軟，易壓破，在溫度適宜的情況下，患部迅速擴大，侵及全果。果實發病腐敗后，產生酸臭味，表面長出白色、致密的薄霉層，略皺褶，為病菌的氣生菌絲及分生孢子，爛果最后成為一堆潰不成形的膠粘物。
  (7)炭疽病(colletotrichumgloeosporioides penz．) 癥狀有干痕、淚痕和腐爛三種不同的類型。干疤型癥狀多出現在果腰部位，病斑圓形或近圓形，凹陷，黃褐色或深褐色，病部果皮成革質或硬化，病變組織限于果皮層。淚痕型癥狀是在陰雨蒙蒙或潮濕的條件下，大量的分生孢子從果蒂流到臍部，病菌侵害果實表皮層而形成紅褐色或暗紅色的條狀痕斑，僅影響果實外觀，病菌不侵入白皮層。腐爛型癥狀主要出現在貯藏期，多從果蒂部或靠近果蒂部位開始發病，初為淡褐色水漬狀，后變為褐色而腐爛。病斑的邊緣整齊，先果皮腐爛而后引起果肉腐爛。
  真菌病害的防治要從栽培管理抓起，做好果園的病蟲害防治；搞好果樹修剪，要通風透光，清除病蟲果、枝、葉，減少病源；加強肥水管理，使樹體強壯，果實抗病性強。果實采后進行防腐藥劑處理， 目前用得較多的防腐劑有多菌靈、托布津、苯來特、抑霉唑、仲丁胺等。目前殺菌劑對青綠霉病的防治都比較有效，而對其它病害的效果不一。

2．生理性病害
  (1)褐斑病 病變多數發生在果蒂周圍，果身有時也有出現。初期為淺褐色不規則斑點，以后顏色逐漸變深，病斑擴大；在低溫條件下，病斑以蒂部為中心發展成為不規則的環形，每環之間有些地方相連，有些地方明顯分開。病斑處油胞破裂，凹陷干縮，病變部位僅限于有色皮層，但時間長了，病斑下的白皮層變干，果實風味異變。
防治方法：①果實采收不宜過晚，應適當提早采收，可以減少貯藏期發病；②適當控制貯藏庫中的溫度、濕度和二氧化碳含量。使庫溫10℃左右、相對濕度85%以上，庫內二氧化碳含量不超過4%，氧氣含量不低于10%。
  (2)枯水 枯水的果實外觀完好，果肉汁胞變硬、變空、變白、缺汁而粒化；或者汁胞干縮缺汁。果皮變厚，白皮層疏松，油胞層內油壓降低，色變淡而透明，脆裂，易與白皮層分離。中心柱空隙大，囊壁變厚。果實風味變淡，嚴重枯水的果實食之無水無味。條件下病果皮質地堅韌，在高濕條件下病果長出白色絨毛菌絲。此病在貯藏期傳染甚速，在窖內可以使全窖腐爛，在木箱內全箱腐爛。
  防治措施：對柚類果實枯水，目前還缺乏十分有效的防治措施。采前加強果園的肥水管理；采前噴20ul／l赤霉素；適期采收；適當延長預貯時間；提供適宜的溫濕度貯藏；這些措施可以減輕果實枯水的發生。