不良反應一： 免疫接種本身對家禽就是一種應激，這種應激有時會造成嚴重的不良反應，如產蛋量劇減，甚至造成家禽死亡。
防范措施： 免疫接種時使用一些抗應激藥物以及在日糧中添加多種維生素。

不良反應二： 注射接種法使家禽的皮膚受到損傷，容易使病原微生物侵入禽體，引起發病。
防范措施： 注射接種疫苗要掌握正確的注射方法和操作技術，注射器械應嚴格消毒；也可以在接種疫苗24小時以后在日糧中添加一些抗菌藥物預防感染。

不良反應三： 高免蛋黃液和抗血清均屬于異體蛋白，給家禽注射后可能會出現過敏反應，甚至會造成部分家禽死亡。
防范措施： 臨床上如家禽不是急性發病或死亡時，不應首先選用高免蛋黃液和抗血清進行治療，即使要用也應選擇同種動物制備的高免蛋黃液和抗血清。

不良反應四： 有些弱毒疫苗接種后會出現輕微的不良反應，這是允許的；但有時這種不良反應會超過該產品所規定的范圍。
防范措施： 改用其他廠家的產品。

不良反應五： 有些病毒性疫苗接種后家禽會出現強烈的不良反應，如雞喉氣管炎弱毒疫苗在涂肛接種后3～5天，可引起雞泄殖腔發炎水腫，滴眼免疫后會造成部分雞出現不同程度的眼結膜炎和食欲減退等癥狀，嚴重時會造成失明。
防范措施： 使用病毒性疫苗應注意以下事項：（1）盡可能避免使用強毒苗，特別是沒有暴發過某種疫病的地區，要嚴禁使用。（2）雞喉氣管炎疫苗只能對一只眼進行滴眼免疫，否則會造成兩只眼睛出現結膜炎或眼盲。（3）在家禽日糧或飲水中添加一些多維、電解質等藥物。

不良反應六： 使用滅活疫苗后有時會在注射部位出現不易吸收的硬結或出現局部組織潰瘍、壞死，這是由于滅活疫苗中含有的佐劑，如氫氧化鋁、明礬、礦物質等造成的。
防范措施： （1）選擇正規廠家生產的疫苗，要求佐劑純化好，疫苗乳化好、不分層、不破乳。（2）注射部位應選擇頸部皮下或胸部肌肉發達的部位，不要在肌肉較少的部位注射。（3）如果注射疫苗的劑量較大，尤其是雛禽，最好采用多點注射方法。

不良反應七： 疫苗使用方法錯誤造成的不良反應。如新城疫Ⅰ系疫苗用在小日齡家禽，特別是缺乏母源抗體而又未經弱毒疫苗進行過基礎免疫的家禽時，會出現較為嚴重的不良反應，甚至會造成死亡。
防范措施： 使用疫苗時，一定要認清疫苗的種類、使用對象和方法。特別是活毒疫苗，使用方法錯誤不僅會造成嚴重的不良反應，甚至還會造成病毒擴散的嚴重后果。

不良反應八： 對已患病的家禽進行免疫接種，常會出現嚴重的不良反應，促使死亡加快，死亡率迅速提高。
防范措施： 對于患病較重的禽群不適宜用疫苗進行接種，而應使用高免蛋黃液和抗血清進行治療。