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藥物預防是針對不同地區、不同犬場在不同時期常發的某些疾病，有目的地選用某些化學藥物、抗生素或中草藥等，加入到犬食或飲水中，或給犬直接投服，以預防肉犬發生疾病或對某些疾病進行早期治療的一種重要的疾病防制措施。犬的許多疾病，特別是某些傳染性疾病，目前尚無有效的疫苗用于預防，但某些藥物卻能較好地控制和減少這些疾病的發生與流行，尤其是在這些疫病的流行季節之前或流行初期，選用適宜的藥物及早進行預防，效果更為明顯。
藥物預防通常選用一些安全、有效且價廉的藥物。如每隔15～20天給犬連飲3天0.1％高錳酸鉀水或0.2％土霉素水有良好的疾病防治作用；在鉤端螺旋體病流行季節，給飼料中加入土霉素(0.75～1.5克/千克)或按1～1.5克/千克體重喂服四環素，連用7天，可控制犬感染本��；內服磺胺類藥物、大蒜或大蒜酊等可防治犬副傷寒、大腸桿菌病等；內服促菌生，應用桿菌肽等飼料添加劑，可預防胃腸炎等消化道疾病，并有刺激或促進犬生長的作用；在蚊蠅出現前1個月至出現后2個月內，每天喂食海群生(6.6毫克/千克體重)，配合每月1次口服伊維菌素(6微克/千克體重)和殺螨菌素，可抑制心絲蟲幼蟲的發育，防止蟲體到達心臟而發病等。
但應注意：若長期不間斷用藥易使病原體產生耐藥性，從而影響預防效果，如有發病者使用同類藥物治療效果也差；還可能因使體內正常菌群紊亂和藥物蓄積等而誘發維生素缺乏癥、慢性中毒等一些不易診治的疾病。因此，預防用藥應注意藥物的選擇和用量，反對將藥物作為飼料添加劑長期不間斷地使用。在肉犬出欄屠宰前一段時期，應盡可能減少用藥或不用藥物，以免藥物殘留而影響肉品質量和危害人體健康。
