一、做好環境消毒，減少傳染源。被水淹沒過的圈舍、圍欄、飼喂用具等應當經過徹底消毒，才能重新使用。一般可采取沖洗、日曬等物理方法，也可選用石灰水、燒堿、過氧乙酸、酚類等化學消毒劑進行消毒。牲畜墊草全部焚燒，牲畜糞便采取堆積發酵的方法進行處理。常用消毒藥品及其使用方法：（1）石灰水：用新鮮石灰配成的10%至20%的石灰水，可用來消毒場地，粉刷棚圈墻壁等。石灰水的配制方法為：1公斤生石灰加4公斤至9公斤水。先將生石灰放在桶內，加少量水使其溶解，然后加足水量。石灰水現配現用，放置時間過長會失效。（2）草木灰水：適用于對棚圈、用具和器械等的消毒。草木灰水配制方法為：在10公斤水中加2公斤至3公斤的新鮮草木灰，加熱煮沸（或用熱水浸泡3晝夜），待草木灰水澄清后使用。將草木灰水加熱后使用才有顯著的消毒效果。（3）燒堿：2%燒堿溶液可用來消毒棚圈、場地、用具和車輛等。3%至5%的燒堿溶液可消毒被炭疽芽孢污染的地面。消毒棚圈時，將家畜趕（牽）出欄圈，經半天時間，將消毒過的飼槽、水槽、水泥地或木板地用水沖洗后，再讓家畜進圈。（4）高錳酸鉀、甲醛：對禽舍等密閉空間熏蒸消毒。按每立方米體積用甲醛28ml，高錳酸鉀14g，將高錳酸鉀倒入甲醛，密閉門窗，室內溫度達到15℃，相對濕度達到60%~80%，維持12h。消毒后，要通風2-3天，畜禽方可進棚舍。（5）過氧乙酸：2%至5%的過氧乙酸溶液，可噴霧消毒棚圈、場地、墻壁、用具、車船、糞便等。（6）復合酚：復合酚100倍至300倍液適用于消毒畜舍、場地、污物等。（7）百毒殺：用百毒殺3000倍稀釋液噴灑、沖洗、浸漬，可用來消毒畜舍、機械、器具等。百毒殺2000倍稀釋液可用于緊急預防畜禽舍的消毒。百毒殺10000倍至20000倍稀釋液可用于儲水塔、飲水器消毒，可以殺死微生物、除藻、除臭、改善水質。

二、水災過后，強化免疫。由于沖走、淹死的動物尸體不能得到及時地掩埋或進行衛生處理，因腐敗而污染水源等環境，加上水退后蚊蠅大量孳生繁殖，極易引發和傳播新的動物疫病。洪水將土壤中的一些細菌芽胞沖出地面，可引起接觸的動物感染發病。災后是各種動物疫病最易發生流行的特殊時期，做好動物防疫工作十分重要，區畜牧獸醫局小分隊積極配合各鄉鎮動物防疫管理員緊緊地依靠地方政府組織村獸醫防疫人員深入災區，按當地免疫計劃和免疫程序對漏免和新補欄的動物開展相應疫病（高致病性禽流感、豬瘟、牲畜口蹄疫、高致病性藍耳病等）免疫工作。

三、無害化處理病死、溺死動物。洪水災害使病原大量暴露，易導致動物疫病發生、擴散。特別是一些畜禽被水沖散、發病、死亡。死亡畜禽體內帶有大量致病微生物，如不及時進行無害化處理，及時消毒，任其腐爛發臭，病菌會隨水流、空氣到處擴散，不僅污染環境，還容易引起人畜疫病大流行。對病死、溺死的畜禽，不要食用，更不要隨意亂丟，應進行深埋、焚燒或投入病死動物無害化處理池進行無害化處理，深埋地應選在遠離人畜、水源的地方，坑深2米以上，尸體入坑后，撒上一層石灰或燒堿，再用土填平，填土離地面1.5米左右。

四、加強飼養管理，提高畜禽抗病能力。一要保持畜禽圈舍清潔干燥、通風良好，蚊、蠅較多的地方，可采用殺蟲劑噴灑滅蟲或在圈舍內外煙熏驅蚊。二要多飼喂一些優質飼草飼料，不飼喂霉變飼草飼料以防中毒。三是注意飼料飲水衛生，飼養過程中如果水源受到污染，可在每噸水中加入6～10克漂白粉進行消毒。

五、依法滅病，預防為主。國家對動物防疫實行預防為主的方針，依法滅病是每個公民的職責和義務。廣大畜禽養殖場（戶）應做到以下幾點：發生動物疫情時，應及時報告當地動物防疫部門，以便盡早采取措施，控制疫情蔓延；不出售、不食用以及不隨意丟棄病死、溺死畜禽以防病原體擴散；對患病畜禽停留過的場地、圈舍以及接觸過的用具等要及時進行清洗消毒；出售畜禽前主動向動物防疫監督機構報檢，未經檢疫或檢疫不合格的不準出售。