消毒前不做機械性清除　消毒藥物作用的發揮，必須使藥物接觸到病原微生物，但被消毒的現場會存在大量的有機物，如糞便、飼料殘渣、畜禽分泌物以及其他污物。消毒藥被大量的有機物所消耗，嚴重降低了對病原微生物的作用濃度，因此，徹底的機械清除是有效消毒的前提。機械清除前應先將可拆卸的用具如食槽、水槽、籠具、護仔箱等拆下，運至舍外清掃、浸泡、沖洗、刷刮，并反復消毒。
　　
　　石灰消毒使用方法隨意　新出窯的生石灰是氧化鈣，加入相當于生石灰重量70%－100%的水，即生成疏松的熟石灰，只有這種離解出的氫氧根離子具有殺菌作用。有的場、戶在入場或畜禽入口池中，堆放厚厚的干石灰，這起不到消毒作用。也有的用放置時間過久的熟石灰做消毒用，但它已吸收空氣中的二氧化碳，變成沒有氫氧根離子的碳酸鈣，已完全喪失殺菌消毒作用。使用石灰消毒最好的方法是加水配制成10%－20%的石灰乳，用于涂刷畜舍墻壁1－2次。
　　
　　把飲水消毒當作消毒藥水　飲水消毒實際是對飲水的消毒，畜禽喝的是經過消毒的水，而不是喝的消毒藥水。如果任意加大水中消毒藥物的濃度或長期飲用，除可引起急性中毒外，還可殺死或抑制腸道內的正常菌群，對畜禽健康造成危害。所以飲水消毒應該是預防性的，而不是治療性的。
　　
　　選用消毒藥圖方便省事　使用消毒藥有時要調換不同類型的藥物。調換消毒藥要根據消毒對象、目的、疫病種類，以及使用方法而決定，不能任意調換，既要考慮對病原微生物的殺滅作用，又要考慮對人畜無害。有些藥應嚴格按要求配制后使用，不可圖一時方便省事，使用可能沒有消毒作用的藥。