為了避免免疫空檔出現，最好在監測免疫水平的情況下制訂免疫程序。以下免疫程序供參考：

自繁自養育肥豬 20~25日齡，每頭用2~4頭份豬瘟細胞苗肌肉注射；55~60日齡，每頭用4~5頭份豬瘟細胞苗肌肉注射。

引進外源豬育肥 引進后7天內在飼料中添加廣譜抗菌藥物，然后用4~6頭份豬瘟細胞苗肌肉注射。如果這次注射疫苗時豬體重小于20公斤或日齡小于55日齡，最好等到體重達到50公斤時再加強免疫1次，每頭用5~6頭份豬瘟細胞苗肌肉注射。

種豬 每次于斷奶前肌肉注射6頭份豬瘟細胞苗或于重胎期即懷孕后80~100天，用6頭份豬瘟細胞苗肌肉注射。