生豬在飼養中有集中定點排糞尿的習性，發酵床上的糞尿分布不均，糞尿集中的地方，濕度大，從而抑制微生物對豬糞尿的消化降解速度；生豬在發酵床上不停踩踏墊料，使墊料板結，墊料的含氧量減少，墊料處于厭氧發酵，造成墊料腐敗，致使微生物對豬糞尿的降解能力降低。因此每周要翻動、刨松墊料2～3次，并將豬糞分散掩埋在發酵床表面下25 厘米左右的墊料中并與墊料均勻混合，每月要深翻1次墊料，每天要開動發酵床底部抽風機2～4小時，以增加墊料中空氣量，排除濕氣，降低墊料溫度，保持墊料的通透性，便于微生物迅速消化降解豬糞尿。

要經常檢查發酵床墊料的溫度、濕度情況，墊料含水量應控制在45%左右，墊料中心層溫度應控制在45℃左右，溫度、濕度過大時應開啟抽風機排濕，開啟降溫設施進行降溫，打開卷簾和窗戶，利用空氣流動調節溫度和濕度，也可以添加干鋸木屑降低濕度，控制發酵速度從而降低溫度。濕度較低時則需噴水增加墊料濕度。墊料使用一定時間會消耗一部分，這時需要補充墊料，添加微生物飼料添加劑。

通風換氣是調節豬舍環境最重要的手段，因此要根據需要開啟通風換氣設施，保證生豬所需的適宜生長環境。通風換氣設備功率配備要滿足生豬生長對空氣流動量的要求，選用低噪聲的換氣設備。

要定期投放滅鼠藥，及時收集死鼠和殘余鼠藥，并做無害化處理。