1、它必須是有效的，甚至是高效的、速效的、長效的。如果是防病治病制劑，要求它能快速地、有選擇性的殺滅病原體；如果是診斷制劑，它必須有較高的靈敏度、準確性和特異性；如果是水質改良制劑，施用后它應該對水產養殖環境有較明顯的改善作用；如是營養和免疫增強劑，它能使養殖對象的生理機能和生長狀態有明顯的促進作用。總之，無公害漁藥的藥效應該是明顯的。
　　2、它的毒性較小。它必須容易分解或降解，其分解或降解的產物基本上是無害的或者很容易通過其它動物轉換，從而在水產養殖對象的組織或水域環境中消失，避免在養殖對象組織中或環境中積累。另一方面無公害漁藥必須要提供有關的毒性試驗報告，其中包括急性毒性試驗、胚胎毒性試驗、行為反應測定、亞急（慢）性毒性試驗和慢性毒性試驗，特殊毒性試驗；從而確定相關的毒理學指標和參數，確定它的毒性大小。任何毒理學指標不明了的藥物、任何有致畸、致癌、致突變的藥物均不可作為無公害漁藥使用。
　　3、它的副作用較小。藥物在殺滅病原體或改變養殖環境或增強養殖對象免疫反應的同時，會產生一定的副作用，如給養殖對象帶來較大的刺激，從而產生較大的應激反應；如影響養殖動物的正常攝食，從而使生長減緩；如對養殖對象的某些器官或組織帶來不利的影響或副面效應；如使養殖環境發生一些變化而影響了養殖對象的正常生理活動或使環境的修復需要一定的條件和時間；等等。無公害漁藥應使這種副面影響控制在最小的程度，對環境的影響能及時修復，對養殖對象的應激應控制在它們所能承受的范圍內。
　　4、它使用的劑量應盡量的小。只有較小的使用劑量，才會減少其毒副作用，也才會在使用成本上有較大的降低，獲得較大的使用價值。
　　5、必須制定出其合理的給藥方法、給藥劑量、給藥間隔時間和休藥期等參數。同時也應該對有可能引起的毒副作用提出警示。
　　6、具有較好的穩定性。適宜的常溫下保存，便于運輸、銷售和貯藏。
　　7、劑型設計較合理，給藥途徑比較方便。
　　8、有較大的價格優勢。