1.清除敵害。泥鰍的主要敵害有蛙類、水生昆蟲、鳥類及兇猛的肉食性魚類。防治方法：①清除池邊雜草，保持養殖環境衛生，嚴防蛙類侵入，發現蛙類應及時捕捉，蛙卵要及時打撈干凈。②進水口要用鐵篩網圍攔好，防止野雜魚隨流水進入池中。③不讓鳥類接近鰍池，發現鳥類接近鰍池及時驅趕。

2.水霉病。水溫較低或冬季鰍體受傷，開春時節容易感染水霉病。水霉病的癥狀為病鰍身上長滿白色棉絮狀的水霉。防治方法：發現此病，用2%～3%食鹽水浸洗病鰍5～10分鐘，即可治愈。

3.寄生蟲病。泥鰍種苗階段常見有車輪蟲、三代蟲等寄生蟲，被寄生蟲侵襲的鰍苗，常常浮于水面，急促不安，或在水面打轉。防治方法：發現病鰍時，可按1立方米水體用0.5克硫酸銅和0.2克硫酸亞鐵制成的合劑進行全池潑灑；或用0.5%的晶體敵百蟲（1立方米水中放0.5克）全池潑灑。

4.氣泡病。鮮苗階段，由于水中氧氣或其他氣體含量過多，容易導致氣泡病。癥狀為病鰍腸內充氣腹部鼓起，浮于水面。防治方法：發病魚池可用濃度為1克/升食鹽水全池潑灑，或加入新鮮水體。平時投餌注意適量和多樣化，并加強水質管理，預防此病的發生。

5.赤皮病。由于捕撈、運輸過程中碰傷鰍體，或因水質惡化而引起細菌侵入，誘發此病。癥狀為：病鰍的鰭、腹部皮膚及肛門周圍充血潰爛，尾鰭、胸鰭發白潰爛尤為明顯，對泥鰍危害較為嚴重。防治方法：發現此病可按1立方米水體溶解20克呋喃奈斯水溶液，浸洗病鰍15～20分鐘；也可用占在池鰍魚體重0.04%的呋喃奈斯，拌入餌料中連續投喂3天，療效顯著。