一查體表。病魚體表充血、發炎、鱗片脫落，一般是赤皮病；若病魚鰓蓋或鰭基部充血，表皮充血不明顯，肌肉呈點狀充血或塊狀淤血是出血病；病魚腹部膨大，肛門紅腫呈紫紅色，輕壓腹部有乳黃色液體流出是腸炎病；尾柄及腹部兩側有火烙樣的紅斑或表皮腐爛是打印病；生有棉絮狀的白色物是水霉病；體表黏液較多并有小米粒大小、形似臭蟲的蟲體是魚虱病；體表有白色亮點，離水2小時亮點消失是小瓜蟲病；體表有白色斑點，白點之間有出血或紅色斑點是卵甲藻病；部分鱗片處發炎紅腫，有紅點并伴有針狀蟲體寄生是錨頭魚蚤病；魚成群在池水表面或池塘周邊狂游，且頭部充血呈紅色，死亡多且迅速，一般是車輪蟲病；病魚尾柄表皮發白是白皮病；病魚在水中頭部或嘴部明顯發白，離水后不明顯是白嘴病；魚下唇突出呈簸箕口狀，則是因時常缺氧浮頭引起；病魚眼球突出、脫落，且鱗片松立，一般為池水有毒所致；魚體呈彎曲狀是池水中重金屬離子含量較高或有機磷中毒所致。

二查鰓。打開魚鰓蓋，檢查鰓有無異樣，正常的鰓絲整齊、緊密，呈鮮紅色。鰓絲腐爛發白，尖端軟骨外露，并有污泥和黏液是爛鰓病；鰓絲發白呈貧血狀，很可能是鰓霉病或球蟲病；鰓絲末端掛著像蠅蛆一樣的白色小蟲是中華魚蚤病；鰓部浮腫，鰓蓋張開不能閉合，鰓絲呈暗淡色是指環蟲病；鰓絲呈紫紅色并伴有大量黏液多為有機氯中毒所致；鰓絲呈紫紅色，黏液較少則為經常缺氧浮頭所致。

三查腸道。打開病魚腹部，正常的魚腸管中充滿了食物或糞便，腸壁呈鮮紅色。腸管全部或部分充血呈紅色，腸壁不發炎是出血病；充血發炎且伴有大量乳黃色黏液是腸炎病；腸道呈白色且前段腫大，腸內壁有許多白色絮狀小結節為球蟲病或黏孢子蟲病。

根據“三查”所掌握的有關情況，再結合發病季節進行綜合分析，就可以比較準確地診斷魚病，從而做到對癥下藥，收到藥到病除的效果。