日灼病爛果：日灼是在強光照射引起的生理病害，主要發生在果實向陽面上。發病初期被太陽曬成灰白色或淺白色革質狀，病部表面變薄，組織壞死發硬，后期腐生菌侵染，長出灰黑色霉層而腐爛。該病主要是果實局部受熱，灼傷表皮細胞引起。在葉片遮蔭不好，土壤缺水或天氣干熱過度，雨后暴熱，易引起此病發生。應及時澆水，均衡供水，改善田間小氣候。在整枝打杈時適當留兩片葉再摘心，這樣可起到遮陽降溫的作用。　　

臍腐病爛果：果實臍部受害，初呈暗綠色水漬狀斑并迅速擴大，病部皺縮，后期表面凹陷。常因寄生其他病菌而變黑或腐爛。究其原因，主要是因為土壤水分供應不足，辣（甜）椒植株供應鈣元素不平衡，導致果實缺鈣。另外，偏施氮肥，也會影響植株對鈣的吸收，導致果實缺鈣產生臍腐病。可噴灑1%的過磷酸鈣溶液或0.1%的氯化鈣溶液。另外，如病部變黑或腐爛，可結合黑霉病或軟腐病同時防治。　　

軟腐病爛果：初呈水漬狀暗綠色斑，后全果軟腐，具惡臭味，內部果肉腐爛，果皮變白，干縮后果實一般掛在枝條上，遇外力后即脫落。可噴施72%農用鏈霉素或50%DT殺菌劑或40%硫酸鏈霉素可溶性粉劑，每隔7天噴1次，連噴2～3次。　　

疫病爛果：多數先從蒂部染病，呈水漬狀灰綠色病斑，后迅速變褐軟腐。潮濕天氣時，表面長出稀疏的白色霉層，病果干縮不脫落。其他部位如莖杈枝葉上，常有水漬狀褐斑。要注意加強防治。可噴64%殺毒礬與55%瑞毒霉混合液，或58%甲霜靈錳鋅或69%安克錳鋅或60%氟嗎錳鋅等，每隔7天噴1次，連噴2～3次。　　

灰霉病和菌核病引起的爛果：灰霉病以門椒、對椒發病較多，在幼果頂部或蒂部出現褐色水漬狀病斑，后凹陷腐爛，呈暗褐色，表面出現灰色霉層，其它部位癥狀較少。菌核病由果柄發展到全果，呈水漬狀腐爛，淺灰褐色，其它部位也有相似的癥狀。防治：濕度大時可用速克靈煙劑薰，濕度不大時可選噴速克靈菌核凈或50%速克靈與70%甲基托布津混合液，每6天1次，連噴2-3次。