菜籽餅含有芥子苷，在芥子酶催化作用下可水解成有毒物質。菜籽餅的去毒方法為：

（1）將菜籽餅粉碎，然后加水煮沸或通入蒸汽，保持１００℃---１１０℃的溫度處理ｌ小時，使芥子酶失去活性。使用此種方法時要注意加熱時間不宜過久，以防降低蛋白質的飼用價值；并嚴格控制喂量，因為芥子苷仍存在于菜籽餅中，它可能受到其他來源的芥子酶以及腸道或飼料中的微生物所產生的酶的催化分解而繼續產生有毒成分。

（2）由于芥子苷是水溶性的，因此，可用冷水或溫水４０℃左右,浸泡２～４天，每天換水１次，這樣可除去部分芥子苷。但此法養分流失很大。

（3）每１００份菜籽餅用濃氨水4.7－5份，或純堿粉３.５份，用水稀釋后，均勻噴灑到餅中，覆蓋堆放３～５小時，然后置蒸籠中蒸４０－５０分鐘；也可在陽光下曬干或炒干后貯備使用。

（4）選擇向陽、干燥、地溫較高的地方，挖一寬０.８米、深０.７～１米、長度按菜籽餅的數量來確定的１個坑。將菜籽餅粉碎并加水１千克餅加１千克水 雪，浸透泡軟后裝入坑內，頂部和底部各鋪一層草，上蓋土２０厘米以上，２個月后可取出飼用。５

將菜籽餅與青飼料同時青貯后飼用；也可先干喂，喂后暫時不飲水。雖然進行了脫毒處理也要嚴格控制菜籽餅的喂量，以不超過日糧的１０％為宜。