棚室辣椒移栽以后，通常由于溫度、濕度等條件適宜，極易發生根部病害，如根腐病、青枯病和疫病等，造成植株成片枯死，不但延誤季節，而且會造成嚴重減產。因此，對于這些根部病害應及早采取措施加以有效防控。

主要病癥 根腐病：根腐病一般在辣椒定植后至采果盛期發生，染病植株的枝葉白天發生萎蔫，傍晚至次日凌晨恢復，反復多日后導致整株枯死。觀察根部，病株的根及根莖部皮層呈淺褐色至褐色腐爛，而且易剝離，多由側根蔓延至主根。青枯病：青枯病是一種細菌性病害，苗期癥狀表現不明顯，定植后從主根基部開始逐步枯死，根莖的表層不變色，縱剖根莖部，可見維管束變成暗褐色。疫病：染病后植株根莖部初呈水漬狀，后變黑褐色很快繞莖1周，病部稍縊縮，造成整個植株萎蔫枯死。在危害根莖部的同時，還危害植株的莖杈分枝，一般表現為褐色或黑褐色條形病斑。

防治方法 堅持合理輪作：前茬以種植十字花科和豆科作物以及蔥、蒜等為宜，盡量避免與茄果類、瓜類等作物連作。加強棚室管理：隨時做好棚室的通風換氣，調節好棚室內的溫度和濕度，以控制病害發生條件；科學澆水，提倡小水澆灌或膜下滴灌，切忌大水漫灌，嚴防土壤積水；注意做好淺中耕，避免土壤板結，但不要過早過深培土；增施以有機肥為主的磷鉀肥料，促進根葉穩健生長，增強植株抗性。注意清理田園：隨時掌握辣椒生長狀況，一旦發現病株要及時拔除，帶到棚外集中燒毀或深埋，并隨即清除病穴土壤，噴灌石灰水或用藥劑對病穴進行消毒處理，以控制病菌的傳播蔓延。做好藥劑防治：對辣椒根部病害要早發現、早防治，要抓住發病初期及時用藥防治。一般防治根腐病可用50%甲基硫菌靈可濕性粉劑500倍液，或50%多菌靈可濕性粉劑600倍液，或50%甲霜靈錳鋅可濕性粉劑600倍液，或綠亨二號500倍液灌根，每次每株灌0.5公斤，可7天灌1次，連灌3~4次；對青枯病可用綠乳銅600倍液，或抗菌劑“401”500倍液，或70%代森錳鋅500倍液，或75%百菌清可濕性粉劑600倍液灌根，每次每株灌0.5公斤，可7天灌1次，連灌3~4次；對辣椒疫病可用50%甲霜銅可濕性粉劑500倍液，或50%甲霜靈錳鋅可濕性粉劑500倍液，或72.2%普力克水劑600~800倍液灌根，每次每株灌0.5公斤，可7天灌1次，連灌3~4次。注意：藥劑要交替使用。