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1、速凍貯藏。選鮮嫩、無病蟲害的苦瓜放到清水中洗凈。去籽去瓤切成瓜圈、瓜塊或瓜片，盛于竹筐內，連籃浸入沸水中燙漂0.5-1分鐘，切的形狀不同，燙漂時間也不同。燙漂時要不停地攪勻。燙漂后迅速撈出，并浸入冷水中冷卻，使瓜溫在短時間內降至5-8℃，后撈出放入竹筐內瀝干。再立即放入冷庫內速凍，庫內溫度應控制在-30℃，以菜體溫度達-18℃為宜。在速凍過程中翻動2-3次，促進冰晶形成和防止菜體間凍成坨。用食品袋裝好封口，再裝入紙箱。裝箱后的苦瓜放入徹底清潔和消毒過-18℃的冷卻庫內貯存，速凍苦瓜一般可保存6-8個月。
2、地窖貯藏。選地下庫、地窖、防空洞等作貯藏庫，并采取必要的通風措施。將預貯后的苦瓜裝箱、裝筐或堆放在菜架上作短期貯藏。貯藏溫度宜穩定在13-15℃，相對濕度控制在85-90%，可隨撿隨賣。
3、鮮瓜冷庫貯藏。將經預處理的苦瓜果實盛于經漂白粉洗滌消毒后的竹筐或塑料筐中，放入冷庫中貯藏。苦瓜貯藏時，庫溫應掌握在10-13℃范圍內，相對濕度85%左右。冷庫內苦瓜貯存時間相對較長。
4、鮮瓜氣調貯藏。有條件的可采用此種方法。人為改變貯藏產品周圍的大氣組成，使氧氣和二氧化碳濃度保持一定比例，以創造并維持產品所要求的氣體組成。氣調可與冷藏配合進行，也可在常溫下進行。苦瓜氣調貯藏的溫度一般在10-18℃之間，同時以氧氣分壓控制在2-3%，二氧化碳分壓在5%以下為宜。氣調貯藏中比較簡單的是薄膜封閉貯藏，其中又分為塑料帳封閉貯藏和薄膜包裝袋封閉貯藏。它們均可用于運輸途中，成本低，易推廣。
5、運輸、包裝貯藏要求。苦瓜對運輸和包裝的具體要求，與采收地至集散地或銷售地的距離及氣候條件等因素有關。地產地銷及中短途運輸可采用常溫運輸；炎熱天氣或遇雨，要有遮蔭和遮雨設施，防止日曬、雨淋；嚴冬季節要采用防寒措施，如蓋棉被、或稻苫等。以加襯筐裝為宜，若用散裝，則要碼放牢固并加鋪墊，以免造成損失。如長途運輸則應采用低溫運輸，以加內襯的紙箱、竹筐等做包裝，嚴禁與釋放乙烯較多的果蔬混運。
