馬鈴薯屬于無性繁殖的作物，通常利用塊莖作種，多種病害極易通過塊莖世代傳遞和擴大危害，而且馬鈴薯種薯用量大，繁殖系數低，運輸和貯藏要求高。因此，馬鈴薯種薯繁育工作一定要從“質”和“量”兩個角度同時入手。在提“質”方面，主要是降低品種退化速度，保持品種特性;在提高“量”方面，主要采取有效措施實現高倍繁殖，加速新品種的推廣利用。
 
提高馬鈴薯種薯繁育質量的方法
 
　　提高馬鈴薯生產水平的主要方法，除了加大抗病品種選育研究、用種子生產實生種薯等途徑外，重點應搞好馬鈴薯良種繁育工作，特別要注意防止混雜和感染病毒病或其他病害，以保證純度和質量，確保種薯健康無病毒。
 
選優留種法
 
　　去雜去劣留種 該方法經常應用在退化現象輕微的留種田。在馬鈴薯整個生育期中一般要進行3次去劣去雜。第一次是在出苗后15天將卷葉、皺縮花葉、矮生、束頂等病株拔除。這次病株拔除是至關重要的，因該階段幼苗最易感病，早拔除病株可以早消滅毒源，防止擴大浸染。第二次是在花期拔除退化株或病株以及花色、株型與栽培品種有顯著差異的雜株。第三次是在收獲前將矮小株或已經枯死的病株拔除，并在收獲后將畸形薯及發生病害的薯去除，將那些具有原品種典型性狀的種薯妥善處理后保存入窖。
 
　　單株混合留種 該方法主要通過在花期對那些生長發育良好且表現原品種典型性狀的植株進行標記，并在生育期內復查2～3次，一旦發現已標記植株患病或有其他異常，應立即清除。在收獲前認真復查一次，把生長發育良好的標記種薯統一采收，將具有原品種典型性狀的塊莖收集在一起，作為種薯供下年使用。
 
　　株系選種 第一年進行單株選擇，其方法與前述的單株混選相同。將收獲的單株塊莖分別裝袋貯藏。第二年進行株系比較，連續進行2～3代比較。每個入選單株塊莖種10～20株，形成一個株系(最好用整薯播種)。生育期間經常觀察，淘汰感病株系，選擇高產、生長整齊一致、無“退化”癥狀的株系作為下一代的入選優良株系。第三年或第四年將選得的優良株系塊莖擴繁后作種薯。
 　　
夏播留種法
 
　　該方法為單季栽培地區常用的留種方式之一。這些地區馬鈴薯播種一般集中在4月底或5月初，而蚜蟲作為馬鈴薯間傳毒的主要害蟲，其在盛夏高溫季節大量繁殖遷飛，導致馬鈴薯病毒病嚴重，種薯質量低。若把種薯的播種時間推遲到6月底至7月中旬，出苗后蚜蟲已大量減少，而8月雨水較多即使有少數有翅蚜蟲，在多雨季節也不易遷飛，傳毒機會減少，因而可有效避開蚜蟲傳毒高峰期，提高種薯質量。
 
實生種薯生產
 
　　用種子生產的實生薯，一般在種植3年后增產優勢即表現不明顯。為保持實生薯持續的增產能力，需在連續種植3年后重新開展育苗工作，及時更換實生薯。主要方法是用實生苗生產的實生薯建立留種田，通過留種田生產的種子為大田生產提供種薯。
 
提高馬鈴薯種薯繁育數量的方法
 
　　在常規生產中，馬鈴薯按塊莖方式繁育，繁殖系數一般為10～15倍。因馬鈴薯具有多器官均可繁殖的生理特性，在實際生產中可充分利用其芽眼和芽進行繁殖，全面提高馬鈴薯繁殖系數，若操作方法得當，繁育系數一般能提高到數百倍甚至數千倍，可加快良種生產進程。
 
切單芽塊法
 
　　馬鈴薯塊莖每個芽眼上都至少有一個主芽以及2個以上的副芽，當主芽萌發時，副芽發育會受到抑制，而當主芽發育被破壞后，副芽則可萌發并同樣發育成植株。該方法是充分利用塊莖上每個芽眼中的多個副芽，提高繁育數量。具體操作方法：在播種前1個月，將種薯放置于20℃左右的環境中進行催芽。待種薯萌發出芽時，按芽對種薯進行切塊。切芽時先由基部開始，按芽分布的部位呈螺旋狀向頂部削切。基部芽眼稀疏，切塊可適當大些，可由芽眉中間縱向切開，將芽眼切成2塊，單個切塊重量保持在20克以上，這樣可提高種薯利用率30%左右。
 
掰芽育苗法
 
　　某些新引入或新育成的品種，往往種薯數量偏少，應用該方法可快速提高種薯的數量，為大量繁殖提供穩定的原種薯源。具體操作方法：于馬鈴薯播種前2～3個月，將種薯放于溫室或溫床育苗，為防止芽苗徒長，要適當加強光照。待芽長15厘米左右時，即可開始掰芽。掰芽時，將芽苗小心地由種薯芽眼基部掰下，栽到適宜的溫床上，栽植深度一般為芽苗高的1/2左右。
 
　　隨后將掰去芽的種薯放回原處，并保持適宜的溫度、濕度繼續催芽，促使其他副芽萌發，并進行多次掰芽，一般單個種薯可掰芽3～4次。最后將所掰的芽和薯塊分別栽培到生產地塊。