水稻栽培中的育秧階段是十分重要的，俗話說得好，苗好一半谷。為了適時培育壯秧，水稻育秧技術不斷進步，多年采用的水育秧在北方已經很少應用，原來的濕潤育秧和旱育秧也都有所變化。而現在群眾應用的有薄膜育秧、工廠化育秧以及與機插相配套的秧盤育秧、干旱育秧等。不同育秧方式下，容易發生的病蟲害種類也不一樣。如水育秧田，無論在南方還是北方經常發生的都是爛秧，表現出爛種、爛芽、黑根、青枯和黃枯死苗等癥狀。爛秧又分為生理性和侵染性兩種，前者是低溫和寒流天氣下長期淹水缺氧或鹽堿所致。后者包括綿腐病和立枯病，由病菌（真菌）侵染所致。要控制這兩種病害，除了上述加強管理促進秧苗生長外，發病初期還要及時用藥。可澆灑敵克松、浸種靈、甲霜靈錳鋅等。
　　
　　改用濕潤育秧和旱育秧以后，不再發生爛秧和棉腐病，主要發生立枯病、惡苗病、青枯病，秧田后期可能發生苗稻瘟、胡麻斑病和地下害蟲、灰飛虱、稻薊馬、二化螟等害蟲。在這里重點介紹以下幾種藥劑。一是用氟蟲腈（銳勁特）防蟲。每畝用80％的銳勁特水分散粒劑2克加70％的艾美樂水分散粒劑2克（或5%銳勁特30～40毫升），對水15～30公斤，在水稻2葉1心期后，均勻噴施。如果在水稻移栽前5天，重噴1次，可達到“送嫁藥”的效果，即可防治大田前期灰飛虱、稻薊馬、二化螟等害蟲，兼治三化螟、稻象甲等。也可以選用48%毒死蜱、25%速滅威、20％啶蟲脒、25%噻嗪酮或10%吡蟲啉。二是用惡霉靈防病。惡霉靈是一種內吸性殺菌劑，同時又是一種土壤消毒劑。可以和種子干拌或濕拌，每公斤種子用原藥1克（30%水劑3.3克）。也可以對秧田或苗床土壤及營養土消毒。做法是：先將原藥用水稀釋成3000倍藥液（1克原藥加3公斤水），在簡塑盤育秧時，每盤用稀釋液0.5公斤。秧田旱育、濕潤育秧時，每平方米苗床用稀釋液3公斤，可有效地控制立枯病，兼治惡苗病。秧田后期發生稻瘟病和紋枯病可用稻瘟靈、稻瘟凈或三環唑防治。
　　
　　最近幾年，水稻條紋葉枯病十分猖獗。它是由灰飛虱傳播的一種病毒病。在一些地區，水稻秧田期是灰飛虱遷飛和傳毒的高峰期，水稻的最易感染期。由于感染病毒的植株在秧苗期并不一定表現癥狀，所以廣大農戶不重視秧田期的防治工作，移栽以后往往爆發成災。我們提倡在條紋葉枯病常發區秧田用藥防治。可以選用吡蟲啉、銳勁特、異丙威等藥劑，也建議農民朋友交替使用以上藥劑，以防止產生抗性。