1.根
屬于須根系,有種根和不定根之別。種根又稱初生根,只有一條,由胚根直接發育而成,在幼苗期營吸收作用,以后枯死。不定根又稱永久根,由莖基部的莖節上生出,其上再發生支根。陸稻、早播稻濕潤管理時,嫩根伸長區之上表皮細胞外壁延伸出多量根毛,但在水層中生長的水稻不長根毛或根毛極少。根的頂端有生長點,外有帽狀根冠保護。根的數量、長度、分布、伸展角度等因環境條件而變化。根的橫剖面由中柱、皮層和表皮等三部分構成,中柱內有木質部的大導管十余個成輻射狀排列,韌皮部與后生木質部相間排列。皮層細胞間隙擴大呈空洞,形成裂生通氣組織,以進行氣體的輸送。
2.莖
一般呈圓筒形,中空,莖上有節。葉著生在節上,上下兩節之間稱節間。莖基部有7~13個節間不伸長,稱為蘗節;莖的上部有4~7個明顯、伸長的節間,形成莖稈。一般生育期長的品種莖節數和伸長節間數較多,生育期短的品種較少。節表面隆起,內部充實,外層是表皮,細胞壁很厚,節組織中的厚壁細胞充滿原生質,生活力旺盛,比其他部分含有較多的糖分、淀粉等。節的髓部與其上下節中心腔分界處具有肥厚細胞壁的石細胞層,稱橫隔壁,將兩個中心腔隔開。葉、分蘗及根的輸導組織都在莖內匯合,因此節內維管束的配置比較復雜。節間的橫剖面可分為表皮、下皮、薄壁組織、維管束和機械組織各部分。內部有中心腔,外部有縱溝,每個節間下部幼嫩部分有分生組織,稱居間分生組織,由葉鞘保護。莖節是稻株體內輸氣系統的樞紐,各方面的通氣組織在此相互聯通,節部通氣組織還與根的皮層細胞相連,所以這種從葉片到根系間以莖節部通氣組織為樞紐的完善的輸氣系統是旱生禾谷類作物所沒有的。
3.葉
互生于莖的兩側,為1/2葉序。主莖葉數與莖節數一致,其數目多少與品種、生育期有直接關系。早熟品種約有9~13片葉;中熟品種約有14~16片葉;晚熟品種的葉數在16片以上。稻葉可分為葉鞘和葉片兩部分,在其交界處有葉枕、葉耳和葉舌。發芽時最先出現的為芽鞘,其次在莖基上長出一片不完全葉,沒有葉片,呈筒狀,以下順次長出有葉鞘和葉片的完全葉。葉鞘分表皮、薄壁組織、維管束和機械組織等部分。整個葉鞘卷抱在莖的周圍,在鞘的兩緣重合部分為膜狀,鞘呈綠色或紅、紫色,也能營光合作用。葉舌為膜狀,無色。葉耳較小由較肥厚的薄壁細胞組成,邊緣有茸毛,在葉鞘上端環抱莖稈,葉枕與葉片主脈連接成三角形。葉片上有平行的葉脈,剖面分表皮、薄壁組織、機械組織和大小維管束等部分,表皮有表皮細胞、茸毛、氣孔和泡狀細胞。氣孔排列整齊,莖稈上部的葉氣孔較多,同一葉中亦以先端較多,表面比背面多。葉肉細胞中含很多葉綠體,光合作用在葉綠體內進行。葉片的長短、大小、彎直和葉色濃淡,都因品種類型、環境條件和栽培措施而不同.
4.穗
為復總狀花序,由穗軸(主梗)、一次枝梗、二次枝梗(間或有三次枝梗)、小穗梗和小穗組成。穗軸上一般有8~15個穗節,穗頸節為最下1個穗節。每個穗節上著生1個枝梗。每個枝梗上著生若干個小穗梗,小穗梗末端著生1個小穗,即穎花。小穗基部有兩個穎片,退化呈兩個小突起,稱副護穎。每個小穗有3朵小花,只有上部1朵小花發育正常,下部兩朵小花退化,各剩1個穎片,稱為護穎。水稻穎花包括內外穎各1個,雄蕊6枚,漿片2枚和雌蕊1枚。雄蕊有花絲和花藥兩部分,雌蕊由二裂的帚狀柱頭、花柱和子房組成。
5.谷粒和米粒
穎花受精結實成谷粒。谷粒一般內部含l粒糙米,即穎果。復粒品種含2~3粒甚至更多。糙米外部有內外穎包被的谷殼,其邊緣互相鉤合,鉤合的縫線在扁形稻粒的中間而不在兩邊,此為稻屬的分類特征。穎色因品種而異,一般為稈黃色,也有黃、棕、褐、紅、紫、條斑等色,穎的頂端為穎尖,有稈黃、黃、褐、淡黑褐、紫黑褐等色,為品種重要特征。穎的表面有鉤狀或針狀茸毛。米粒與谷粒形狀近似,有橢圓形、闊卵形、短圓形、直背形、新月形等。米色有白、乳白、紅、紫等色。米粒構造分果皮、種皮、糊粉層、胚乳和胚等部分。米的色素在種皮內。胚乳在種皮之內,占米粒最大部分,由含淀粉的細胞組織構成。胚由卵細胞的卵核同精于受精后發育而成,為新的有機體的原始體,由胚軸、盾片、胚芽、胚芽鞘、胚根等組成。