灰霉病    該病在田間大量發生時，往往造成葉枯，最后導致植株枯死。在高濕情況下，葉背病斑部可見灰色霉狀物，為病原菌的分生孢子。

    防治百合灰霉病的關鍵是注意通風，不能密植，宜采用滴灌方式供水。在容易發病的季節，因連續使用單一藥劑可能導致病原菌發生抗藥性，故可用對口藥劑輪流使用，每隔7～10天噴施1次。

    疫病    該病可造成百合莖部、花器枯萎腐敗及全株萎凋死亡。

    防治百合疫病的關鍵是避免連作，筑高畦以利排水。發病時切勿溝畦灌溉，發病初期可用防治疫病的藥劑輪流使用，每隔7～10天1次。

    莖腐病    該病主要是由鐮孢菌為害種球、鱗片及莖部造成的，當百合種球及鱗片受害后，植株生長矮化且葉片呈現淡綠色。

    由于本病害為土傳播性真菌病害，可采用與水稻輪作的方式進行防治。亦可將土壤經淹水兩個月及曝曬后再行種植，以避免鐮孢菌危害。同時可用對口殺菌藥及時防治，每7天噴霧1次。

    青霉病    該病主要是在貯藏期間危害鱗莖、葉、莖。貯藏期間，在鱗片腐爛斑點上首先長出白點，然后會長出絨毛狀的綠蘭色的真菌。

    防治本病可用50%撲海因可濕性粉劑500倍液浸泡10分鐘，撈出晾干后貯藏。同時應盡可能不要種植那些基盤已被侵害的鱗莖。貯藏期以－2℃～2℃的溫度范圍內為宜。

    葉片焦枯    葉片焦枯是百合生理性病害，首先是幼葉稍向內卷曲，數天之后，焦枯的葉片上出現綠黃色至白色的斑點。若葉片焦枯較輕，植株還可繼續正常生長；但若植株焦枯嚴重，白色斑點可轉變成褐色，傷害病害發生處，葉片彎曲。當植株吸水和蒸發之間的平衡被破壞時較易出現葉片焦枯，這是吸水或蒸騰不足引起幼葉細胞缺鈣的結果。

    該病防治方法要注意三點：1.對危害根系的病蟲害要有效地控制，種植前應使土壤濕潤；2.要種植具有良好根系的鱗莖，種植深度要適宜，在鱗莖的上方應有6～10cm的土層；3.盡量保持相對濕度在75%左右，防止過速生長和過度的蒸騰。

    缺鐵    幼葉葉脈間的葉肉組織呈黃綠色，尤其是生長迅速的植株。植株越缺鐵，葉片將變得越黃。若確保土壤排水良好，土壤PH5.5～7.0，可預防缺鐵。若植株缺鐵，可根據植株的顏色，對缺鐵植株噴施1～2次螯合態鐵，即EDTA-Fe。

    市面上防治百合病害的藥劑很多，要購買到對口優質農藥，建議最好到當地農技部門咨詢，對癥下藥，減少成本。