一、培養基質攜帶多種病蟲源 絕大多數的致病菌和有害昆蟲的寄主都是有機質。如稻草、棉籽殼和禽畜糞便等本身就攜帶大量病菌孢子、菌體、螨蟲和蚊蠅等蟲卵：在使用前需要將培養基做滅菌處理或發酵處理，以消滅或減少病蟲源的基數，減輕痛蟲害為害程度。

二、營養豐富的栽培基質為病蟲繁殖提供了良好的食源 許多的害蟲和病菌以腐熟的有機質為食源，如：跳蟲、螨蟲、癭蚊、線蟲、白蟻和蚤蠅等昆蟲都喜食腐熟潮濕的有機質。經發酵熟化后用于栽培蘑菇、草菇和雞腿蘑及白靈菇的基質能散發出特有的氣味，吸引昆蟲成蟲在料里產卵。在食源豐富的情況下，螨蟲、癭蚊能以母體繁殖方式在短時間內快速地增殖后代，往往在30~40天后暴發成災。熟化的基質也是競爭性雜菌的快速繁殖基地，如木霉、根霉、鏈孢霉孢子落入富含麩皮、玉米粉、棉籽殼并經過滅菌熟化后的基質內能快速繁殖，而同時接種的白靈菇菌種的生長速度慢，而雜菌生長速度遠大于白靈菇菌絲生長速度。未經滅菌和熟化的培養基質，曲霉等雜菌未能侵染，一旦滅菌熟化后，雜菌很快地繁殖。

三、適宜的出菇環境為病蟲繁殖提供優越條件 白靈菇發菌溫度在20~26℃，出菇溫度在10~15℃，培養基含水量在62%左右，出菇場所空氣濕度在85%以上。適宜的環境使菌絲生長加快，出菇順利，與此同時也適合某些病蟲生活的條件。

四、食用菌與病菌在生理特性上差異性小，生理特性較一致 許多殺菌藥易傷害菌絲和菇體，產生藥害。例如，甲基硫菌靈和百菌清用于拌料，易抑制菌絲生長。多菌靈對白靈菇菌絲都有抑制作用，施用敵敵畏后導致不出菇或出畸形菇。

五、病蟲同時侵入，交叉侵染 菇蚊、菇蠅身上攜帶螨蟲和病菌，當其在培養基和菇體上取食和產卵時就傳播病毒、螨蟲和病菌，進而傳染整個環境。

六、病蟲侵害面廣，繁殖量大，暴發性強 致病菌在前期未被觀察到時，已在培養基內萌發和生長繁殖，一旦發現時已造成為害。菌絲在發菌期時無法用藥控制，在出菇期有的病害需要多次用藥，而有的病害無藥可治，如細菌性的斑點病和黃菇病等要用藥3次以上才能控制病情。螨蟲、癭蚊、菇蚊從培養基質、菌絲到菇體都能取食為害，在培養基的表面和里層都有蟲體分布取食為害。