番茄發生晚疫病，幼苗、葉、莖和果實均可受害，以葉和青果受害最重。幼苗染病，病斑由葉片向莖稈蔓延，使莖稈變細并呈黑褐色，導致全株萎蔫或折倒，濕度大時病部產生白霉。葉片染病，多從植株下部葉片的葉尖或葉緣開始發病，病斑初為暗綠色不規則水浸狀，擴大后轉為褐色，濕度大時葉背病健交界處產生白霉。莖上病斑呈黑褐色腐敗狀，引起植株萎蔫。果實受害，主要發生在青果上，病斑初呈暗綠色油浸狀，后變成暗褐色至棕褐色，稍凹陷，邊緣明顯，云紋不規則，病果一般不變軟，濕度大時病部長出少量白霉，并迅速腐爛。

該病屬真菌性病害，病菌只危害番茄和馬鈴薯，以對番茄的致病性最強。病菌主要在冬季栽培的番茄植株及馬鈴薯塊莖中越冬，有時以厚垣孢子隨病殘體在土中越冬。借氣流或雨水傳播到番茄植株上，從氣孔或表皮直接侵入，在田間形成中心病株，隨后病部產生孢子，借風雨傳播進行再侵染。該病多在氣溫白天24℃以下、夜間10℃以上時發生，能否流行取決于有無飽和的相對濕度或水滴，降雨是影響發病程度的重要條件。地勢低洼，排水不良，田間濕度大，易發病。

預防保護地番茄晚疫病，應從苗期開始嚴格控制棚室條件，防止出現高濕條件；生長期間及時打杈，增加通風透光性；重病田可與非茄科作物實行3年以上輪作。藥劑防治有多種施藥方式，一是煙霧法，每畝用45％百菌清煙劑200～250克熏煙；二是粉塵法，每畝噴5％百菌清粉塵劑1公斤；三是噴霧法，適用藥有普力克72.2%霜霉威鹽酸鹽水劑、殺毒礬64% 霉·錳鋅可濕性粉劑、70%乙鋁·錳鋅可濕性粉劑等，每隔7～10天一次，連續防治4～5次；四是灌根法，可用50%琥銅·甲霜可濕性粉劑600倍液，或60％琥銅·乙膦鋁可濕性粉劑400倍液灌根，每株灌藥液300毫升，每隔10天一次，連續防治3次。