芽枯病發生部位一般在植株第二、第三穗果的著生處附近。發病株腋芽處出現縱縫，形成裂痕，呈豎“一”字形或“Y”形，裂痕邊緣有時不整齊，但沒有蟲糞，可說明非蟲害造成。芽枯病發生嚴重的植株，生長點枯死不再向上生長，而是出現多分枝向上長的情況。這種情況主要發生于夏秋保護地栽培的西紅柿上。

二、防治方法

1.西紅柿定植后注意中午放風，不使棚室內溫度超過35℃；或采用遮陽網覆蓋，以降低光照強度，避免造成高溫危害；也可以在高溫的中午，在葉面噴灑清水，以降低周圍溫度。

2.實行配方施肥，并適當增加硼、鋅等微肥的施用。

3.在高溫階段要注意保持土壤濕度，保持地面見干見濕(不要大水漫灌，以防裂果)，保證根系正常的吸收功能，促進肥效的充分發揮。

4.當發生芽枯病以后，要注意培養出新的結果果穗，去掉一些徒長枝杈，在適當的位置留一穗生長較好的花序，用它代替失去的果穗，以減少產量損失。