對抗藻類之生長幾乎是不可能的,大部份藻類的孢子只有數毫米大(1 mm ,等于千分之一公尺)，通常在新魚或新水草進入水族箱時，也會將這些孢子帶進來，另外在換水時也可能引進孢子。因此，我們只得假設水族箱之中會有大量的藻類，縱使眼睛看不到它們，但它們只是伺機等待合適的狀況，大量的繁殖。

　　在過去數年之間，我們由一些熱帶國家中，尤其是亞洲國家，引進的魚類及水草數量增加，因此也為我們的水族箱添加了許多熱帶藻類，這些藻類不論是在大自然或在水族箱的溫度中，都可以找到適合其生長的絕佳環境。

　　保護水族箱不受藻類寄生的最佳方法，就是預防藻類生長環境的發展。因此我們會建議在水族箱最初，就密集種植生長迅速的水草，如此水族箱在這緊要關頭上，才能盡快地進入狀況。一旦水族箱內出現了大量的藻類，就表示水族箱中的系統一定是出了問題了，相反地，水族箱中若是種植妥當，且水草強壯的話，幾乎很少會出現藻類的。但實際情況卻很少如此。我們有過太多的例子，持續的忽略藻類所形成的問題，因此毀去了水族箱養殖的樂趣。

　　對抗藻類第一個方法就是多去了解藻類及它和水草之間的關系。首先我們要知道藻類也是一種水生植物，但其結構比其它水族箱內的水草簡單。原則上這二類植物對光線、溫度及營養均有相同的需要。當然，最后在水族箱之中一些微小的差異就可以決定出水族箱環境究竟是適合水草生長或利于藻類生存。

　　由于水草及藻類生存需求相似，所以可以了解的是，它們二者在養分上是競爭對手。因而我們可以將藻類視為一種寄生蟲。因為它們會和水草競爭食物及空間。如果水草的生長環境中，只要有一方面不完全，或是養分的供給不平衡，水草會馬上生長遲鈍，而此時藻類就會進攻，并自發性地繁殖，勝過其他的高等植物。

　　水族箱設立后的短時間之內，會出現最大的藻類危機，是其最關鍵的時刻。因為在這段建構初期，水族箱內生物功能尚未能理想的發生作用，同時新栽入的水草也必須發育其根部才能開始生長，所以它們也不能全力地進行合成作用，自然也就無法全力地維護自己的生命。

　　● 藍藻

　　藍藻最容易在水族箱初設時出現。它們具有特別的危險性，因為它們生長得非常迅速， 對于仍無法維持自己生命的水草而言，藍藻更會形成一層脂膜，抑制水草呼吸，我們常稱這種皮膜般的外皮為薄膜藻類(Smearalgae)，其顏色常為藍綠色，偶爾亦為黑、紫或棕色。一開始時，我們應盡量以機械性方法將這些藻類弄走，雖然這不太可能，因為只要有少量殘余藻類，它們就可以在短時間之內再次成長成大群的藻類。而不幸的是，目前并無任何已知的魚類或蝸牛可用來作為藍藻的生物天敵。目前市面上有販售一些化學物質，可作為緊急對付藍藻之用。

　　● 紅藻

　　除了藍藻之外，水族箱中幾乎沒有任何一種藻類會比這種所謂須狀藻、刷狀藻或樅藻的紅藻類更具破壞力。這種藻類會攻擊植物、石頭及小塊石頭。須狀藻會長出一種長須，主要攻擊葉緣及莖部。而刷狀藻會在葉面、根及莖上形成濃密的刷狀物質，其生長方式與草坪極為相似。

　　這些藻類的顏色均為暗綠色，其紅色多被掩蓋住，但是若放在酒精內，則藻類的線狀物就會現出紅色。幸運的是，在魚類之中，我們有一名幫手幫助我們對抗這些藻類：泰國飛狐對須狀藻具有特別的破壞力，但前提是這種魚尚未被水族箱內其他的佳肴寵壞。在此我們也應指出，若使用化學物質來對付藻類，也必須該化學物質不會對植物有害，且可改善植物的生長才有意義。
　
　　● 褐藻

　　棕矽藻甚少像藍藻或紅藻一般，在水族箱中大群地出現。但一旦大群出現的話，它們的外形是棕色脂狀膜片，很少是絨狀。這種藻類的出現最常見的原因是光線不良，而使植物的 合成作用也隨即不佳。水中含氧量過低也會使這種藻類的生長加快。通常只要改善水族箱的 光照情形，這些藻類會在很短的時間之內消失。

　　● 綠藻

　　綠藻很少在水族箱中形成群落，它們通常是清澈的綠色，或是亮綠色。它們的生存需求和高等植物較為接近。辨認時可見其綠色（大部分尚是亮綠色），我們可用手或其他工具將這些藻類移走，因為這些藻類的外形多為棉花狀、線狀或刷狀。

　　● 魚類對抗藻類

　　在水族箱初設立之時，我們可以在水族箱內放入以藻類為食的魚類，作為預防藻類生長 的方法之一。

　　● 藻類的緊急處置

　　但是如果水族箱之中，已長滿了成群的藍藻或綠藻，則養魚人在短時間之內可以用化學物質來對抗藻類，但使用時務必小心。我們必須考慮到這些化學物質在不同的濃度之下，不僅會殺死藻類。也可能同時對其他水族箱內的水草造成傷害。依其特性，這些化學物質在稀釋的狀態之下可以攻擊藻類，而僅在高濃度時會對水草產生傷害。所以在使用這些殺藻劑時，應遵守使用說明，并按照處方所指示的濃度使用。

　　我們知道。所有對抗藻類的方法成功與否和養魚人息息相關。他是否經由換水及營養鹽的添加使得水族箱中水草再次復活，也唯有如此水族箱內的系統才可以對藻類的再次侵襲產生免疫力。

　　● 藻類的預防--預防勝于治療

　　時間及理想的水草生長，是預防藻類生長的最佳方法。水草是藻類的天然營養競爭者，但是由于水族箱是完全不同的結構，所以我們極可能忽視這些容易出現的藻類，尤其是在水族箱內磷酸鹽量過高時，如果再加上過量的硝酸鹽，則水族箱無異是多藻類最營養的生長溫床。
　　
　　水族箱中往往會因生物的分解作用，而磷酸鹽含量達到5-10mg／l(大自然水域的磷酸鹽含量約在0.01一1.0 mg／l之間)。雖然過高磷酸鹽對水草的傷害尚未了解，但卻會導致潛在性的藻類大量生長。因為藍藻、須狀藻及刷狀藻等都是磷酸鹽的愛好者。定期測試磷酸鹽含量可預防危險的發生，而定期換水及種植成長快速的水草則是預防藻類生長的最佳方法。

　　1、 一簇綠的絲藻，在某種情況下看起來非常吸引人，但一般而言，它是水族箱中不受歡迎的客人，然而要消滅它卻是非常的困難。
　　
　　2、 紅藻可利用食苔魚來去除。
　　
　　3、 薄膜藻類在水族箱中具有褐色外膜。
　　
　　4、 綠色絲藻的外觀具有很長的細胞，含有許多的細胞核。