為了提高工作質量和工作效率，有效監控食品生產加工企業的食品質量安全問題，各級質量技術監督部門應當使用國家質檢總局編制的食品質量安全監督管理系統軟件，利用計算機建立、管理企業質量檔案，逐步實現利用計算機（網絡）接受和傳遞各級質量技術監督部門之間的管理數據。建立企業質量檔案應注意做好以下工作：
    （1）企業名稱、地址應以企業營業執照依法登記的名稱的地址為準，不要隨意簡化或用俗稱、傳統稱謂代替。
    （2）重視企業代碼（組織機構代碼）的登記。企業代碼是質量技術監督系統代表國家對企業賦予的身份編號和公民身份證一樣具有唯一性，在計算機管理中可以簡便迅速地用于檢索企業質量檔案。因此，在核發《食品生產許可證》時，應當查驗企業代碼證，正確錄入企業代碼。對應辦而未辦理企業代碼的企業應督促其立即辦證，對不在辦理企業代碼范圍內的企業，要驗證企業法人身份證，并登記身份證編號，否則不予發證。
    （3）注意定期采集企業有關信息，更新企業質量檔案，保持企業檔案的時效性，并定期向同級人民政府報告本地區的食品質量安全狀況和向國家質檢總局上報數據及有關情況，使企業質量檔案成為政府宏觀管理和建立信用經濟的有效手段。