基因治療是未來疾病治療的方式之一，但真正由單一基因決定的遺傳疾病，大約只占全部遺傳疾病的0.5％，目前正研究如何運用基因治療的方式治療一些由非單一基因決定的遺傳疾病，并進一步推廣應用到其它疾病上。
基因治療似乎遠景無限，但仍然有許多問題需要克服，如體細胞所做的基因治療，是將取自人體的細胞，如白血球、骨髓細胞、肝臟細胞、肌肉細胞等，在體外做組織培養，然后經由各種化學、機械或生物方法（如利用以基因工程修飾過的無毒性病毒做為基因媒介），把經過基因工程方法矯正的或正常的基因送入這些細胞里，等待充分證實了這些細胞的活性與安全性后，再把這些「治療過」的細胞送回人體，如此可望在人體內發揮正常基因的作用。
但是這種在體外處理的方法，由于矯正過的細胞仍免不了衰亡，所以必須定期地接受追加治療，因此執行上仍不夠方便。理想中，如果能將「正�！沟幕�，經由注射或吸入的方式，送至基因作用的目標器官或細胞，用來更正目標細胞的缺陷基因，那就可以使疾病得到控制或消失。
一項成功的基因治療包含了許多因素，其中最首要的就是如何使「正�！够蚰軌蝽樌氐竭_目標細胞中，然后再考慮如何使「正�！够蜻m當地表現等問題。目前較常使用于基因治療的基因輸送系統，是生物載體基因輸送系統，這類生物載體主要是以病毒為主，如反轉錄病毒和腺病毒，但使用病毒做為輸送載體，必須考慮它是否能把基因輸送至特定的組織細胞，以及病毒是否會造成危害的生物安全性等問題，因此細胞受體調解法就成了較佳的取代方式。
由于細胞受體調解法在以往大多是利用化學方法，使配體與DNA結合區結合，因此沒有辦法控制與配體結合的DNA結合區數量，也沒有辦法控制每一DNA結合區結合到配體的數目，因此利用基因工程的方法加以改進，應該能進一步提升細胞受體調解法的效果。
以基因工程的技術，使綠膿桿菌外毒素Ａ的受體結合區和移位區與做為DNA結合區的氨基酸序列結合，形成具攜帶DNA能力的融合蛋白。其中所含的DNA結合區帶有正電荷，能結合帶負電荷的DNA，利用綠膿桿菌外毒素Ａ的受體結合區與哺乳動物細胞膜上的低密度脂蛋白細胞受體結合后，進入細胞的內膜體中，再經由綠膿桿菌外毒素Ａ移位區的作用進入細胞質中，而將DNA送入細胞內，因此這個融合蛋白可以應用在基因治療的基因輸送工作上。另外，也可以利用基因工程的技術修改綠膿桿菌外毒素Ａ的受體結合區，使此一DNA輸送融合蛋白具有特定細胞的專一性，進而可以更加廣泛地應用在基因治療上。
基因工程是一項新的技術，因為這項技術能夠運用并改造生物，充分利用生物資源，所以具有不可忽視的發展潛力。以綠膿桿菌外毒素Ａ為例，它原本是一個非常毒的毒素，經過基礎研究之后，我們可以利用基因工程的方式加以改造，使其成為具有多種醫療用途的蛋白質，諸如抗癌用免疫毒素、疫苗發展及基因治療等多種用途。
但也因為基因工程具有永久改造生物基因、進而改造生物的可能性，所以也潛在著無法預知的副作用。因此在各層面的基因工程操作及使用上，都需要充分評估管理，才能在不影響生物的自然生態平衡下，達到造福人群的功效。