真菌和植物作為無性生殖的方式所形成的生殖細胞。它和配子不同，能單獨形成新的個體（世代）。形成孢子并進行生殖的世代稱作孢子體。各分類群各有其獨特的生活史，因此無性孢子的繁殖方法也多種多樣，不同的類群每有其特殊的孢子形態、大小、形成部位和形成方式，而同一種類也常產生各種各樣的孢子，并各有其特定的名稱。孢子有真孢子和營養孢子，前者是由特定的二倍體（2n）細胞通過減數分裂形成的，其核相為單倍的（n）；后者則與此相反，是身體的一部分直接通過分裂產生的（真菌的厚垣孢子，分生抱子，銹菌的冬孢子，銹孢子等）。如果孢子在孢子囊中形成，稱為內生孢子；如果是在體外游離的小細胞具有孢子的特性，則稱為外生孢子。如果同一個體所形成的孢子形態相同，稱為同形孢子；如有大小二種形態，則稱為異形孢子。孢子一般是單細胞，但在半知菌等類中，也有多隔的多細胞孢子；在菌絲頂端生出的為頂生孢子。從孢子外形上看，可分為節孢子、芽狀孢子、絲狀孢子、原始孢子、柄生孢子、網狀孢子、星狀孢子、卷曲狀孢子以及干孢子、粘孢子等；還有無色透明的無色孢子、褐色和黑色的暗色孢子。蕨類植物的孢子在12℃以下多不能發芽，多數孢子發芽的最適溫度是25—30℃；紅色鏈孢霉的子囊孢子，發芽需要高溫，所以有的在火災之后發芽生長。一般除真菌的孢子外，其他孢子在完全黑暗的環境中不能或很難發芽。某些寄生真菌如果不侵入一定的寄主體內，便不能發芽（如銹菌、黑穗菌）。孢子發芽的方式有時也是分類學上的特征，這在蕨類植物的瓶爾小草目（Ophioglossales）、紫萁科（Osmund－aceae）、金雞腳假茀蕨（Polypodium hastaum，Phymatopsis hastata）等三類植物中是很明顯的。原垣孢子及苔蘚和蕨類的孢子具有很厚的外壁，壽命很長，有的過1年以后仍能發芽。紅藻的果孢和四分孢子在放出體外12—24小時內即可發芽。所以孢子期極短。在真菌中，冬孢子等可以越冬，其生存期在1年以上，厚垣孢子有的可活數年，但水生真菌的游動孢子和青霉菌的分生孢子壽命很短。