為了在遺傳學、腫瘤學、免疫學及生理學等廣泛的領域中進行醫學生物學的研究而培育的純系動物。以小鼠最多，有A系、CBA系及C3H系等數百個系統。此外也曾培育出兔、土撥鼠、狗和雞的純系。在古典的遺傳學常用果蠅或蠶蛾為純系。為了培育純系，要連續作20代以上的同親雌雄間的交配（兄妹交配），使99％以上的基因保持同型狀態，這種把繼續保持同親個體間交配的系統稱為近交系（inbredstrain）。作為純系來說其可靠度最高，因在純系內個體間沒有基因變異，故可能進行組織或腫瘤的移植。另外在純系中有的可發生特定的疾病（各種腫瘤、自身免疫病、高血壓及糖尿病等），這也是人工選擇的結果，是醫學上基礎研究的重要材料。