形成親本型和重組型配子，但前者多于后者。在玉米，籽粒有色（A）對無色（a）呈顯性，飽滿（B）對凹陷（b）呈顯性，而且它們是連鎖的。利用具有這兩種性狀的親本雜交，其測交結果如下表：
親本型和重組型百分數(shù)分別為：
（4035 4032）/8368=96.4（％）
（149 152）/8368=3.6（％）*
由于測交一代的表現(xiàn)型類型和比例直接反映F1產(chǎn)生的配子類型和比例，可知F1不僅產(chǎn)生親本型配子AB和ab（占多數(shù)），還產(chǎn)生了重組型配子Ab和aB（占少數(shù)）。上述現(xiàn)象的發(fā)生，是因為多數(shù)初級性母細胞減數(shù)分裂時，兩連鎖基因間的非姊妹染色單體未發(fā)生互換，因此只形成兩類數(shù)目相等的親本型配子，少數(shù)初級性母細胞兩連鎖基因的非姊妹染色單體發(fā)生了互換，形成了數(shù)目相等的親本型配子和重組型配子。所以，不完全連鎖時，從總體來看，雙因子雜種產(chǎn)生的親本型配子數(shù)多于重組型配子數(shù)（圖2）。由于不完全連鎖基因同時具有連鎖和互換的傾向，是生物的普遍現(xiàn)象，又由于對一定生物來說，兩特定不完全連鎖基因間的互換百分數(shù)是一定的，所以把不完全連鎖基因的這種傳遞規(guī)律，稱為連鎖互換規(guī)律。
基因相距很遠的不完全連鎖 親本型配子和重組型配子相等（圖3）。這種現(xiàn)象一般發(fā)生在兩個不完全連鎖基因相距很遠時，使得每個初級性母細胞都可在這兩基因所在的非姊妹染色單體間發(fā)生一個單互換或奇數(shù)互換。這種情況下的遺傳與兩非連鎖基因的自由組合難以區(qū)分。
連鎖基因遺傳規(guī)律在理論上證實了基因位在染色體上，染色體是基因的載體，基因在染色體上呈直線排列，為基因定位奠定了理論基礎；基因的連鎖和互換，可使有利基因組合在一起和增加變異，因此有利于進化。在育種實踐上可加強育種工作的預見性，如果選育的兩性狀屬連鎖遺傳，且希望通過互換的非等位基因重組來選育新品種，則在相同選擇效果的條件下，連鎖群體的雜種群體要比獨立遺傳的大，且互換率越小，要求的雜種群體越大。此外還可提高選擇效率，例如，大麥稈銹病一般要到抽穗后才發(fā)生，因此在生育前期無法鑒定和選擇抗稈銹病植株。
后來發(fā)現(xiàn)，抗稈銹病大麥的苗期有一特點——葉片黃綠色。這是黃綠色基因和抗稈銹病基因連鎖的結果。這樣，在苗期只保留葉片黃綠色的幼苗，就相當于保留抗稈銹病植株。抽穗后，再復查一次，把抗稈銹病和豐產(chǎn)的選出來，這樣可大大提高選擇效率。
