類型I已知基因的序列
(1)已知DNA序列,包括三種情況,一是已知目的基因的DNA全部或部分DNA序列(與題目要求略有出入);二是已知其它物種的同類基因的DNA序列(功能可能已知,與題目要求略有出入);三是已知目的基因cDNA全部或部分序列(屬于題目要求已達(dá)到的類型)。
(2)已知目的基因表達(dá)產(chǎn)物蛋白等序列。
在這兩種情況下一般采用PCR技術(shù)或探針分子雜交技術(shù)分離克隆目的基因。
類型II已有基因圖位或標(biāo)記,轉(zhuǎn)座子等條件,分別可采用轉(zhuǎn)座子標(biāo)簽法、T-DNA標(biāo)簽法及圖位克隆技術(shù)進(jìn)行分離克隆目的基因。
類型III為止目的基因序列
(1)差異表達(dá)序列,即目的基因表達(dá)具有組織、器官等時(shí)空差異性。可以采用隨機(jī)引物多態(tài)性擴(kuò)增技術(shù),定向引物擴(kuò)增技術(shù)和DDRT-PCR、SSH-PCR、RAP-PCR、DNA-RDA、cDNA捕捉法等進(jìn)行克隆。
(2)無差異表達(dá)的目的基因,可采用文庫篩選法、功能蛋白分離法即直接測須發(fā)等進(jìn)行,是難度較大較繁瑣的策略。
從基因分離克隆的方法進(jìn)行分類可分為三類:一種類型是功能克隆,即根據(jù)已知基因的產(chǎn)物推斷出其相應(yīng)核苷酸序列,再根據(jù)此序列合成寡聚核苷酸探針。從cDNA文庫或基因組文庫中調(diào)取目的基因。第二種類型是表型克隆。是近年來發(fā)展十分迅速的一類方法,例如差異篩選法、差減雜交(SH)、mRNA差別顯示技術(shù)(DDRT-PCR)、代表性差異分析(RAD)抑制型差減雜交(SSH)等。第三類是無基因序列及表達(dá)功能信息,但具有基因遺傳圖,轉(zhuǎn)座子標(biāo)簽等條件,常用圖位克隆和轉(zhuǎn)座子標(biāo)簽法克隆。