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siRNA制備方法比較

放大字體  縮小字體 發(fā)布日期:2006-07-06

比較項(xiàng)目

化學(xué)合成

體外轉(zhuǎn)錄

RNase III降解dsRNA

siRNA
表達(dá)載體

PCR
表達(dá)框

材料需求

21-mer RNA
oligos(
一對(duì))

29-mer DNA oligos(一對(duì))

轉(zhuǎn)錄模版 (200-1000bp,兩側(cè)帶T7 啟動(dòng)子)

55-60-mer DNA oligos(一對(duì))

~50-mer DNA oligos(一對(duì))

全部制備/合成時(shí)間所需時(shí)間

4—2

24 小時(shí) DNA oligo合成時(shí)間

1 轉(zhuǎn)錄模版制備時(shí)間

5天以上 DNA oligo合成時(shí)間

~ 6 小時(shí) DNA oligo合成時(shí)間

個(gè)人所需操作時(shí)間

幾乎不需要*

中等

中等

中等

是否需要驗(yàn)證和尋找最有效siRNA

需要

需要

不需要

需要

需要

能否標(biāo)記siRNA (例如用于熒光顯微鏡分析siRNA進(jìn)入細(xì)胞過程或者在細(xì)胞中的定位)

不能

不能

轉(zhuǎn)染的相對(duì)難易程度

可篩選性 (例如抗生素篩選)

不可以

不可以

不可以

可以

不可以

能否用于長(zhǎng)效抑制

不可以

不可以

不可以

可以(抗生素篩選)

不可以

能否大規(guī)模制備

可以

有限

有限

可以

有限

檢測(cè)總體轉(zhuǎn)染效率

不可以

不可以

不可以

可以

不可以

每個(gè)基因的相對(duì)費(fèi)用(不包含人力)

中等

中等

中等

*取決于合成后是否包含純化、去保護(hù),以及廠家提供的是已經(jīng)退火的即用型雙鏈還是凍干的單鏈

 
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