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蛋白質結構分類數據庫

放大字體  縮小字體 發布日期:2006-09-19

    蛋白質結構分類(SCOP)數據庫詳細描述了已知的蛋白質結構之間的關系。分類基于若干層次:家族,描述相近的進化關系;超家族,描述遠源的進化關系;折疊子(fold),描述空間幾何結構的關系;折疊類,所有折疊子被歸于全α、全β、α/β、α+β和多結構域等幾個大類。SCOP還提供一個非冗余的ASTRAIL序列庫,這個庫通常被用來評估各種序列比對算法。此外,SCOP還提供一個PDB-ISL中介序列庫,通過與這個庫中序列的兩兩比對,可以找到與未知結構序列遠緣的已知結構序列。

 
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