京都基因和基因組百科全書(KEGG)是系統分析基因功能，聯系基因組信息和功能信息的知識庫。基因組信息存儲在GENES數據庫里，包括完整和部分測序的基因組序列；更高級的功能信息存儲在PATHWAY數據庫里，包括圖解的細胞生化過程如代謝、膜轉運、信號傳遞、細胞周期，還包括同系保守的子通路等信息；KEGG的另一個數據庫是LIGAND，包含關于化學物質、酶分子、酶反應等信息。KEGG提供了Java的圖形工具來訪問基因組圖譜，比較基因組圖譜和操作表達圖譜，以及其它序列比較、圖形比較和通路計算的工具，可以免費獲取。
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