富營養化主要是指向水體中投入或排入生物所需的氮、磷等營養物質。如農田灌溉水和含有化肥的農用水；工業廢水和生活污水等。水體富營養化后，在水面上往往出現由藻類形成的一片片“水華”，在近海地區叫“赤潮”。在發生赤潮的水域里，一些浮游生物暴發性繁殖，使水變成紅色，因此叫“赤潮”。這些藻類有惡臭、有毒，魚不能食用。藻類遮蔽陽光，使水底生植物因光合作用受到阻礙而死去，腐敗后放出氮、磷等植物的營養物質，再供藻類利用。這樣年深月久，造成惡性循環，藻類大量繁殖，水質惡化而有腥臭，造成魚類死亡。