為了便于對集裝箱在流通和使用中識別和管理，便于單據(jù)編制和信息傳輸，所以國際標(biāo)準(zhǔn)化組織制定了集裝箱標(biāo)記，此標(biāo)準(zhǔn)即《集裝箱的代號、識別和標(biāo)記》（ISO6346-1981(E)）。
國際標(biāo)準(zhǔn)化組織規(guī)定的標(biāo)記有必備標(biāo)記和自選標(biāo)記兩類，每一類標(biāo)記中又分別標(biāo)記和作業(yè)標(biāo)記。具體來說，集裝箱上有箱主代號；箱號或順序號、核對號；集裝箱尺寸及類型代號。
1、必備標(biāo)記
1）識別標(biāo)記。它包括箱主代好，順序號和核對數(shù)字。
（1）箱主代號。國際標(biāo)準(zhǔn)化組織規(guī)定，箱主代號由四個大寫的拉丁文字母表示，前三位由箱主自己規(guī)定，第四個字母一律用U表示。
（2）順序好，又稱箱號，由6位阿拉伯字母組成。如又小數(shù)字不是6位時，則在有效數(shù)字前用“0”不足6位。如“053842”。
（3）核對數(shù)字。核對數(shù)字是用來對箱主代號和順序號記錄是否準(zhǔn)確的依據(jù)。它位于箱號后，以一位阿拉伯?dāng)?shù)字加一方框表示。
2）作業(yè)標(biāo)記。
它包括以下三個內(nèi)容：
（1）額定重量和自定重量標(biāo)記。額定重量即集裝箱總重,自重即集裝箱空箱質(zhì)量（或空箱重量），ISO688規(guī)定應(yīng)以公斤（kg)和磅（lb)同時表示。
（2）空陸水聯(lián)運集裝箱標(biāo)記。由于該集裝箱的強度僅能堆碼兩層。因而國際標(biāo)準(zhǔn)化組織對該集裝箱規(guī)定了特殊的標(biāo)志，該標(biāo)記為黑色，該位于側(cè)壁和端壁的左上角，并規(guī)定標(biāo)記的最小尺寸為：高127mm,長355mm,字母標(biāo)記的字體高度至少為76mm。
（3）登箱頂觸電警告標(biāo)記。該標(biāo)記喂黃色底各色三角形，一般設(shè)在罐式集裝箱和位于登頂箱頂?shù)姆鎏萏帲跃娴求w者有觸電危險。
2、自選標(biāo)記
1）識別標(biāo)記
它包括（1）國家和地區(qū)代號，如中國用CN；美國用US
（2）尺寸和類型代號（箱型代碼）。
2）作業(yè)標(biāo)記。
它包括（1）超高標(biāo)記，該標(biāo)記為在黃色底上標(biāo)出黑色數(shù)字和邊框，此標(biāo)記貼在集裝箱每側(cè)的左下角，距箱底約0.6m處，同時該貼在集裝箱主要標(biāo)記的下方。凡高度超過2.6m的集裝箱應(yīng)貼上此標(biāo)記。
（2）國際鐵路聯(lián)盟標(biāo)記。凡符合《國際鐵路聯(lián)盟條列》規(guī)定的集裝箱，可以獲得此標(biāo)記。該標(biāo)志是在歐洲鐵路上運輸集裝箱的必要通行標(biāo)志。
3、同行標(biāo)記
集裝箱在運輸過程中能順利的通過或進入它過境，箱上必須貼有按規(guī)定要求的各種通行標(biāo)志，否則，必須辦理繁瑣證明手續(xù)，延長了集裝箱的周轉(zhuǎn)時間。
集裝箱上主要的通行標(biāo)記有；安全合格牌照、集裝箱批準(zhǔn)牌照、防蟲處理板、檢驗合格徽及國際鐵路聯(lián)盟標(biāo)記等。