掌握科學施用復合肥技術首先要摸清復合肥的性狀，同時要了解農作物全生育期對外源營養供應的需求特征以及土壤的基本性狀，包括土壤周年釋放供應養分的數量強度和土壤保水保肥的能力等。這樣說可能讓農民朋友們感到太復雜，但實際生產中有經驗的農戶都是這樣綜合考慮的。
關于復合肥的特性，要從二次加工說起。以配成的復混肥料為例，它們是由不同單質肥料包括尿素、普鈣、氯化鉀等粉狀原料，經過混勻并添加少量黏結劑造粒而成。其外形為顆粒狀，營養成分包括氮、磷、鉀，并有可能添加一種或幾種中、微量元素。復混肥中養分的形態可以是全水溶性的，也可能有少部分不溶性或弱酸溶解的，例如硝酸磷肥就有弱酸溶性和水溶性兩種。因此，復合肥料的主要特征可以歸納為以下幾個方面：一、外觀形狀是有一定抗壓強度的顆粒，施入土壤后可以逐步溶解釋放養分；二、營養成分復雜，既含有氮、磷或鉀又可能含有鈣、鎂、硫、鐵、鉬等微量元素；三、復混肥顆粒中的養分形態多樣，例如氮素，既有可能是脲基態的，也可能是銨態或硝酸態的；磷可能是全水溶性的，也可能是部分水溶性的；鉀可能是硫基也可能是氯基的�？傊�，由單質肥料經過二次加工的復混肥料，它們的成分和技術含量都有提高，因而成本增加，價格也相應提升。因此，復混肥在作物上正確施用需要綜合考慮，只有把復合肥料性狀與土壤、作物的性狀對號入座，才能獲得增產與增收的雙贏。
在上述原則下，復合肥料的具體施用方法可歸納為以下幾點：
1、復合肥料適宜作基肥�；实氖┯梅椒ǎ涸诓シN前耕地時將含有氮磷鉀多種養分的顆粒復肥施入到一定深度的土壤中。施肥的深度因作物而異，糧食和蔬菜的施肥深度一般為20厘米，果樹的施肥深度為30～40厘米。只有將復合肥料施入到一定深度才能供應作物中后期營養的需求。作基肥的復合肥施入作物生育期所需的全部磷和大部分鉀。氮素由于性質太活潑，只能將其一部分通過復合肥施在基肥里，至少一半的氮素要以單質氮肥的形態在作物生長旺盛期作追肥施入。所以復合肥適宜做基肥用，而氮素比例不能太高。
任何一種復混肥料所含氮、磷和鉀的養分比例固定，基肥施用量的計算是以磷或鉀的含量為基準，而氮肥的一半需要放在中后期作追肥施用。
2、復合肥料一般不宜做追肥或水沖施肥。其中的磷肥，既使是全水溶態，施在土表也很少向下移動，作物根系難以利用。盡管廣東的菜農朋友們習慣將進口的通用型45%(15%-15%-15%)含量的復混肥用水溶化后澆灌葉菜有明顯肥效，但是其養分利用率較低，不僅浪費肥料，成本也不合算，需要改進。
中低濃度的氮磷二元復合肥可作種肥施用，但要注意種與肥分開。有機—無機型復合肥可較大量地用做基肥。
3、復混肥料應與單質肥料配合施用。對于作物全生育期營養供應來說，在施用復混肥料作基肥的基礎上，還要用一半單質氮肥或少量鉀肥作追肥，以調節營養元素的比例，使之最終適合作物高產優質對營養的需要。