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PCR反應(yīng)擴(kuò)增產(chǎn)物出現(xiàn)多條帶(雜帶)解決方案

放大字體  縮小字體 發(fā)布日期:2024-07-18  來源:上海撫生實業(yè)有限公司
核心提示:  聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)技術(shù)是在體外進(jìn)行的由引物介導(dǎo)的酶促DNA擴(kuò)增反應(yīng)。PCR的原理是在模板DNA、PCR引物、四種脫氧核糖核苷酸(dN

  聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)技術(shù)是在體外進(jìn)行的由引物介導(dǎo)的酶促DNA擴(kuò)增反應(yīng)。PCR的原理是在模板DNA、PCR引物、四種脫氧核糖核苷酸(dNTP)及適當(dāng)濃度的Mg2+存在的條件下,依賴于DNA聚合酶的體外酶促合成反應(yīng)。兩個引物分別位于靶序列兩端,同兩條模板的3’端互補,由此限定擴(kuò)增片段。PCR反應(yīng)由一系列的變性→退火→延伸反復(fù)循環(huán)構(gòu)成,即在高溫下模板雙鏈DNA變性解鏈,然后在較低溫度下同過量引物退火,再在適中溫度下由DNA聚合酶催化進(jìn)行延伸。理論上,經(jīng)過N次循環(huán)可使特定片段擴(kuò)增到2n-1,考慮到擴(kuò)增效率達(dá)不到100%,所以通常經(jīng)25到30次循環(huán)可擴(kuò)增到106倍,足夠后續(xù)實驗展開。

  擴(kuò)增產(chǎn)物出現(xiàn)多條帶(雜帶):

  1、 引物用量偏大,引物的特異性不高。應(yīng)調(diào)換引物或降低引物的使用量。

  2、 循環(huán)的次數(shù)過多。適當(dāng)增加模板的量,減少循環(huán)次數(shù)。

  3、 酶的用量偏高或酶的質(zhì)量不好,應(yīng)降低酶量或調(diào)換另一來源的酶。

  4、 退火溫度偏低,退火及延伸時間偏長。應(yīng)提高退火溫度,減少變性與延伸時間,也可采用二種溫度的PCR擴(kuò)增。以2度為梯度設(shè)計梯度PCR反應(yīng)優(yōu)化退火溫度。

  5、 樣品處理不當(dāng)。

  6、 Mg2+濃度偏高,因適當(dāng)調(diào)整Mg2+使用濃度。

  7、 若為PCR試劑盒,也可能時試劑盒本身質(zhì)量有問題。

  8、 復(fù)制提前終止。使用非熱啟動的聚合酶時常有發(fā)生。冰上準(zhǔn)備反應(yīng)體系或采用熱啟動聚合酶。

  9、 反應(yīng)緩沖液未全融化或未充分混勻。確保反應(yīng)緩沖液融化全并全混勻。

  10、 引物特異性差。利用BLAST檢查引物特異性或重新設(shè)計引物。

  11、 引物量過多。減少反應(yīng)體系中引物的用量。

  12、 模板量過多。質(zhì)粒DNA的用量應(yīng)<50ng,而基因組DNA則應(yīng)<200ng。

  13、 外源DNA污染。確保操作的潔凈。

編輯:songjiajie2010

 
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