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作業指導書是“有關任務如何實施和記錄的詳細描述”，用以指導某個具體過程，事物所形成的技術性細節的可操作性文件，指導書要求制定的合理、詳細、明了、可操作，實驗室要有以下6個方面的作業指導書：
行政管理類：包括職業道德、公正性、人員安全、與客戶關系，以及其他需要確保實驗室工作人員行為適當的有關問題；
方法類：指導實驗方法的過程（包括標準方法和非標方法以及方法的偏離）
設備管理類：設備的使用、維護、期間核查、內部校準等
樣品管理類：包括樣品的采集、準備、保存和處理等
數據類：包括數據修約、有效數字、異常數據剔除、測量不確定度評定等
安全環保類：包括實驗的過程中的環境、場所、操作過程、危險物品等安全注意事項、以及廢棄物的處置等
作業指導書是技術性的程序，必須批準后方可使用，同時要保證作業指導書可以方便得到。
