FSSC 22000 決定在目前的審核和認證框架下，增加一個基于ISO9001的單獨的認證模塊——食品質量管理體系（QMS），這將為組織提供通過FSSC 22000審核，獲得食品安全和質量管理體系認證的可能。

    是否增加QMS模塊是組織的自愿行為。組織可以選擇只接受食品安全審核，或者是接受一個增加了QMS模塊的FSSC 22000 認證審核，也就是一個整合的食品安全和質量管理體系的審核。

    “食品質量管理體系認證（FoodQMS certification）”超出了全球食品安全管理倡議（GFSI）的基準和認可。但是，GFSI和ISO現行和未來的一切基于有效性和一致性的需求，均將應用于這個新的QMS模塊。這將意味著，提供FSSC 22000 QMS模塊認證的機構，必須獲得ISO9001認可，審核員也必須符合所有相關能力的要求。

    ISO9001標準具備很強的顧客導向性，有助于確保顧客得到始終如一的高品質的產品和服務。它同時包含了產品設計和開發的要求。